69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2929 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  251  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  50.96 
 
 		 117 aa  97.4  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  46.36 
 
 		 115 aa  93.2  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  50.49 
 
 		 121 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  53.85 
 
 		 117 aa  92.4  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  41.8 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  46.85 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  49.46 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  49.02 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  44.14 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  44.14 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.14 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  53.01 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  42.34 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  42.34 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  42.34 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  42.34 
 
 		 115 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  49.41 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  49.44 
 
 		 115 aa  76.6  0.00000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  48.6 
 
 		 121 aa  76.6  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  46.49 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  44.44 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  44.33 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  54.55 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  44.55 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  43.64 
 
 		 133 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  44.33 
 
 		 121 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  44.9 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  45 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  53.09 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  48.1 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  42.72 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  46.32 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  50.55 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  48.54 
 
 		 104 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  45.28 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  53.26 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  44.04 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  46.75 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  46.32 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  65.22 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  63.04 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  38.46 
 
 		 107 aa  57.8  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  43.04 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  45.57 
 
 		 128 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  49.38 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  69.44 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  27.05 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  28.93 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  36.07 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  46.3 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  43.1 
 
 		 129 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  32.61 
 
 		 145 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  42 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35739  predicted protein  35.05 
 
 		 169 aa  41.2  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  30.77 
 
 		 110 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  36.27 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2741  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000241316  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  30.33 
 
 		 120 aa  40  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  59.26 
 
 		 147 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>