51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_64135 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  100 
 
 
149 aa  299  8.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59170  predicted protein  42.74 
 
 
116 aa  100  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.273554 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00682  conserved hypothetical protein  35.56 
 
 
230 aa  78.2  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  29.6 
 
 
131 aa  57.4  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  33.85 
 
 
129 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  28.46 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  30.77 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35739  predicted protein  32.43 
 
 
169 aa  53.1  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  27.2 
 
 
141 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  28.24 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  32.52 
 
 
217 aa  51.6  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  26.23 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  26.23 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  32.77 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  29.66 
 
 
110 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01574  hypothetical protein  35.87 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.400993 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00580  DUF domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G11150)  27.55 
 
 
178 aa  48.1  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.529613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  31.19 
 
 
450 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  28.87 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  63.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  63.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  63.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  63.33 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  63.33 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  27.37 
 
 
100 aa  45.4  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  25.83 
 
 
145 aa  46.2  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  21.58 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  28.07 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  60 
 
 
115 aa  45.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  24.3 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  28.45 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  25.77 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  27.34 
 
 
217 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  27.34 
 
 
217 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  65.52 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  65.52 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  65.52 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  45.24 
 
 
130 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  45.95 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  47.22 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  58.62 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  26.61 
 
 
111 aa  40  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>