67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0811 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  100 
 
 		 115 aa  216  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  42.74 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  45.19 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  45.19 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  45.19 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  42.57 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  43.27 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  43.27 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  43.27 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  43.27 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  50 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  49.41 
 
 		 117 aa  81.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  44.12 
 
 		 115 aa  78.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  44.68 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  46.23 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  46.53 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  51.32 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  42.86 
 
 		 117 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  53.93 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  44.76 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  46.23 
 
 		 121 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  50 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  49.51 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  42.74 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  47.62 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  41.82 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  47.67 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  49.52 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  48.08 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  48.84 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  47.22 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  50.57 
 
 		 119 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  46.15 
 
 		 134 aa  65.1  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  48.15 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  46.15 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  37.25 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  35.58 
 
 		 121 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  41.86 
 
 		 157 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  42.5 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  33.04 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  47.83 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  33.06 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  38.94 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  72.22 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  46.84 
 
 		 128 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  35.19 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  42.45 
 
 		 131 aa  51.6  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  43.9 
 
 		 128 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2698  hypothetical protein  40.48 
 
 		 100 aa  50.1  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000416238  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  39.62 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  63.89 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2391  hypothetical protein  36.99 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.833954  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  48.89 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  45.71 
 
 		 104 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  49.32 
 
 		 126 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  55.56 
 
 		 153 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  34.23 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  31.45 
 
 		 129 aa  40  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>