56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_26250 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  100 
 
 		 121 aa  236  8e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  70.11 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  47.66 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  47.32 
 
 		 117 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  53.19 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  53.49 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  53.49 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  54.65 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  53.49 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  47.62 
 
 		 130 aa  87  7e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  50.47 
 
 		 121 aa  86.7  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  42.31 
 
 		 115 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  39.42 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  39.42 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  39.42 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  39.42 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  37.29 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  37.29 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  37.29 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  39.42 
 
 		 115 aa  77.8  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  49.04 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  41.51 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  45.24 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  47.62 
 
 		 115 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  40.54 
 
 		 111 aa  73.9  0.0000000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  55.56 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  44.14 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  49.35 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  47 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  40.19 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  53.57 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  52.56 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  39.18 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  40.95 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  45.12 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  53.75 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  39.74 
 
 		 107 aa  64.3  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  39.81 
 
 		 113 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  44.12 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  36.3 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  45.12 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  41.67 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  47.37 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  55.32 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  45.45 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  35.14 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  40.66 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  62.86 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>