65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1718 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  65.65 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  54.17 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  54.24 
 
 		 140 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  56.73 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  64.12 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  59.34 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  63.74 
 
 		 139 aa  92.8  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  58.02 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  49.06 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  48.57 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  42.5 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  51.95 
 
 		 113 aa  80.1  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  46.43 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  39.81 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  46.81 
 
 		 128 aa  76.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  51.65 
 
 		 117 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  43.64 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  43.64 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  43.64 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  40.38 
 
 		 115 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  43.48 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  46.23 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  49.35 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  50.6 
 
 		 121 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  37.5 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  37.5 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  37.5 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  37.5 
 
 		 115 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  47.31 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  49.4 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  36.97 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  46.91 
 
 		 115 aa  67  0.00000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  49.09 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  43.59 
 
 		 139 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  39.18 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  82.35 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  48.96 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  40.91 
 
 		 107 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  43.4 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  43.12 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  78.12 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  45.88 
 
 		 119 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  47.37 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  51.06 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  37.31 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  37.31 
 
 		 217 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  45.9 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  48.04 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  54.55 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15281  predicted protein  30.67 
 
 		 112 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.002411  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  28.24 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35739  predicted protein  33.64 
 
 		 169 aa  41.6  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  31.07 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  62.96 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>