41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1079 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  33.87 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  32.71 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  39.45 
 
 
141 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  32.04 
 
 
217 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  37.5 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  36.84 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  31.93 
 
 
217 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  31.93 
 
 
217 aa  62.8  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  39.08 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  36.9 
 
 
111 aa  59.7  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  44.78 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  36.11 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  36.56 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  28.57 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  31.91 
 
 
450 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  36.11 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  40.79 
 
 
153 aa  57  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  28.12 
 
 
139 aa  56.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  35.65 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  31.43 
 
 
122 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  33.67 
 
 
128 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  45.95 
 
 
120 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  35.71 
 
 
131 aa  50.4  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  32.35 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  41.67 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  31.07 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  76.92 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  62.07 
 
 
130 aa  43.9  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  29.91 
 
 
131 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35739  predicted protein  29.1 
 
 
169 aa  43.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  34.88 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  69.23 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  69.23 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  55.88 
 
 
140 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  69.23 
 
 
117 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1463  protein of unknown function DUF202  28.57 
 
 
186 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  59.26 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  48.57 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  65.38 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59170  predicted protein  27.37 
 
 
116 aa  40  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.273554 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>