43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1541 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  216  1e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  65 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  36.11 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  36.13 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  40.52 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  40.52 
 
 		 217 aa  72.8  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  34.21 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  36.84 
 
 		 147 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  59.57 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  35.8 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  35.8 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  35.29 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  34.62 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  46.77 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  36 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  32.38 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  29.7 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  29.59 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  36.13 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  34.18 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  40.79 
 
 		 120 aa  51.6  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  30.12 
 
 		 450 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  43.75 
 
 		 111 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  35.48 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  33.03 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  43.21 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  33 
 
 		 124 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  32.63 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  31.96 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  30.77 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  30.56 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  54.55 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  29.03 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  51.52 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  28.16 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  35.44 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  47.37 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  57.58 
 
 		 128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  47.62 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  54.55 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>