26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5709 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
123 aa  234  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  45 
 
 
125 aa  95.9  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  36.21 
 
 
123 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  43.69 
 
 
153 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  46.43 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  34.31 
 
 
450 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  33.33 
 
 
124 aa  53.5  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  29.63 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  29.63 
 
 
217 aa  52  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  61.29 
 
 
217 aa  48.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  37.78 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  34.52 
 
 
110 aa  45.4  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 
134 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  32.56 
 
 
129 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  34.55 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  37.65 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  35.48 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  33.62 
 
 
127 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  33.63 
 
 
139 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  40.85 
 
 
145 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  39.33 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  41.94 
 
 
129 aa  40.8  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  32.32 
 
 
147 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  32.84 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  36.9 
 
 
131 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>