28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2754 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  218  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  36.84 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  37.5 
 
 
217 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  37.5 
 
 
217 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  36.9 
 
 
147 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  40.37 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  41.25 
 
 
125 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  29.13 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  36.25 
 
 
217 aa  55.5  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  40 
 
 
153 aa  55.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  32.67 
 
 
141 aa  55.1  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  34.65 
 
 
110 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  27.27 
 
 
126 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  31.03 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  40.96 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  40.96 
 
 
144 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  30.77 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  35 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 
129 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  54.84 
 
 
129 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  66.67 
 
 
100 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  42.37 
 
 
450 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  62.07 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1199  protein of unknown function DUF202  35 
 
 
139 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.065628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  65.38 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5709  protein of unknown function DUF202  40.68 
 
 
123 aa  42  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  46.81 
 
 
124 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>