53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6983 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  100 
 
 		 126 aa  250  5.000000000000001e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  57.36 
 
 		 129 aa  139  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  36.11 
 
 		 110 aa  74.3  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  37.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  37.84 
 
 		 217 aa  73.2  0.000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  33.87 
 
 		 147 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  37.84 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  35.09 
 
 		 129 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  30.43 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  30.43 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  32.14 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  41.67 
 
 		 100 aa  60.8  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  36.07 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  30.25 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0884  protein of unknown function DUF202  30.36 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  28.93 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  36.19 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2128  protein of unknown function DUF202  33.33 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  35.16 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1871  hypothetical protein  38.27 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  30.7 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  30.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  28.33 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  30.16 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  30.16 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  30.16 
 
 		 117 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  33.65 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  34.4 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2754  hypothetical protein  26.97 
 
 		 111 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1758  hypothetical protein  37.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  28 
 
 		 450 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  25 
 
 		 129 aa  47  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2917  protein of unknown function DUF202  35.8 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  45.95 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  30.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  30.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  30.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  30.83 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  28.89 
 
 		 147 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4628  hypothetical protein  30.49 
 
 		 127 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  31.76 
 
 		 107 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.783904 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  27.52 
 
 		 115 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  29.27 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>