30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2902 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2902  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
122 aa  247  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5020  hypothetical protein  32.59 
 
 
141 aa  63.9  0.0000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.166016  normal  0.244596 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6983  protein of unknown function DUF202  36.07 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000702592  hitchhiker  0.0000000170628 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4468  protein of unknown function DUF202  27.35 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0195387  normal  0.458647 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4405  protein of unknown function DUF202  27.35 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1610  hypothetical protein  31.53 
 
 
131 aa  57  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.567401  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1079  hypothetical protein  31.43 
 
 
147 aa  54.3  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2161  hypothetical protein  28.57 
 
 
129 aa  53.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.274618 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1591  protein of unknown function DUF202  25.81 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2586  hypothetical protein  29.63 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.862205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2846  protein of unknown function DUF202  27.62 
 
 
147 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.750643  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1541  hypothetical protein  29.59 
 
 
110 aa  52  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.909246  normal  0.0140954 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1959  protein of unknown function DUF202  36.25 
 
 
100 aa  52  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1270  protein of unknown function DUF202  27.5 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.608137  normal  0.262107 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1554  hypothetical protein  27.5 
 
 
217 aa  48.9  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  32.67 
 
 
111 aa  47.8  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0982  protein of unknown function DUF202  28.18 
 
 
217 aa  46.2  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000195459  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2481  protein of unknown function DUF202  29.25 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.395372  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0664  hypothetical protein  30.19 
 
 
130 aa  45.4  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1368  protein of unknown function DUF202  29.89 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.862394  hitchhiker  0.0026719 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64135  predicted protein  29.41 
 
 
149 aa  44.7  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.498947 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0462  hypothetical protein  31.9 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0849  hypothetical protein  59.26 
 
 
129 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.464553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  32.43 
 
 
120 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  28.83 
 
 
121 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  30.7 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  41.43 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  41.43 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  41.43 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  35.53 
 
 
157 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>