57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2740 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2740  protein of unknown function DUF202  100 
 
 
119 aa  232  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000277057  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26250  predicted membrane protein  65.42 
 
 
121 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5317  hypothetical protein  49.09 
 
 
117 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.619923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5406  hypothetical protein  49.09 
 
 
117 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385872  normal  0.0586693 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5696  hypothetical protein  49.09 
 
 
117 aa  99  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5846  hypothetical protein  58.14 
 
 
117 aa  96.3  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.434453 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12890  predicted membrane protein  55.56 
 
 
117 aa  90.5  7e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0978  hypothetical protein  51.02 
 
 
121 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0151  protein of unknown function DUF202  47.06 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0019  hypothetical protein  45.63 
 
 
115 aa  85.1  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0811  protein of unknown function DUF202  51.81 
 
 
115 aa  82.8  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.507491  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3966  protein of unknown function DUF202  50.53 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1024  hypothetical protein  54.32 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.486251  hitchhiker  0.000764257 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1719  hypothetical protein  43.93 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4194  inner membrane protein YidH  45.63 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4031  inner membrane protein YidH  45.63 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4014  inner membrane protein YidH  45.63 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.506622  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4086  inner membrane protein YidH  45.63 
 
 
115 aa  79  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03503  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.799269  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0027  Isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5108  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.316723 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4242  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4042  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.783904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0024  isocitrate dehydrogenase (NADP(+))  46.6 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4184  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0074  hypothetical protein  43.4 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3889  hypothetical protein  46.6 
 
 
115 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03560  conserved inner membrane protein  46.6 
 
 
115 aa  78.2  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.785327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1696  hypothetical protein  46.73 
 
 
140 aa  77.4  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4135  hypothetical protein  50.6 
 
 
115 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2929  hypothetical protein  46.15 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0171  hypothetical protein  47.06 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0154  protein of unknown function DUF202  45.78 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12298  transmembrane protein  50 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1177  protein of unknown function DUF202  45.28 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0582675  normal  0.137438 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25700  predicted membrane protein  43.33 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.242945 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1527  protein of unknown function DUF202  39.62 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0383  protein of unknown function DUF202  41.44 
 
 
111 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2741  hypothetical protein  37.74 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0500  protein of unknown function DUF202  45 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1146  hypothetical protein  48.19 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.817406  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1718  hypothetical protein  45.45 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117272  normal  0.098151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04300  predicted membrane protein  47.78 
 
 
139 aa  63.2  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6525  hypothetical protein  40.91 
 
 
113 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3235  protein of unknown function DUF202  42.11 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3058  protein of unknown function DUF202  50 
 
 
120 aa  61.6  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.426571  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4409  protein of unknown function DUF202  37.18 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.74916  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2302  protein of unknown function DUF202  36.81 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2202  hypothetical protein  41.57 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480813  normal  0.604814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3719  protein of unknown function DUF202  47.56 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0159805 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1696  protein of unknown function DUF202  35.9 
 
 
131 aa  55.1  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0533832  normal  0.205442 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5393  protein of unknown function DUF202  45.45 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3698  hypothetical protein  41.33 
 
 
128 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3153  hypothetical protein  41.98 
 
 
128 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.787108  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2939  protein of unknown function DUF202  60 
 
 
139 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0371875  hitchhiker  0.00232341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2044  hypothetical protein  62.5 
 
 
128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.207277  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00125  hypothetical protein  55.56 
 
 
116 aa  40.4  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.682772  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>