49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19491 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_19491  sodium dependent transporter  100 
 
 		 284 aa  546  1e-154  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1644  hypothetical protein  38.66 
 
 		 267 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.515624 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2168  bile acid--sodium symporter  29.64 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0178  Bile acid:sodium symporter  29.62 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1200  protein of unknown function DUF202  31.25 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101516 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0010  Bile acid:sodium symporter  26.39 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2044  bile acid:sodium symporter  24.1 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.104383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2072  bile acid:sodium symporter  23.05 
 
 		 285 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.106303 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2588  Bile acid:sodium symporter  25.3 
 
 		 322 aa  55.5  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.527927  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2140  bile acid:sodium symporter  21.88 
 
 		 307 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0110  sodium symporter  29.25 
 
 		 292 aa  52.8  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0796  bile acid:sodium symporter  22.58 
 
 		 297 aa  52.4  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0236  bile acid:sodium symporter  24.8 
 
 		 321 aa  52.4  0.000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0407  bile acid:sodium symporter  28.46 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.208758  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0951  bile acid:sodium symporter  22.95 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0050  Bile acid:sodium symporter  24.03 
 
 		 312 aa  50.4  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00660635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1227  bile acid:sodium symporter  23.02 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0371  bile acid:sodium symporter  24.43 
 
 		 335 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0981019  normal  0.637314 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02093  P3 protein  25 
 
 		 221 aa  48.5  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000002356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1420  sodium symporter  24.56 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1678  bile acid:sodium symporter  23.2 
 
 		 321 aa  48.5  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2515  bile acid:sodium symporter  27.09 
 
 		 297 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.930351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0630  bile acid:sodium symporter  24.69 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2861  P3 protein  24.72 
 
 		 297 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.934917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0367  Na+-dependent transporter-like  28.14 
 
 		 307 aa  47.4  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2891  bile acid:sodium symporter  24.59 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3247  bile acid/Na+ symporter family protein  27.98 
 
 		 297 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2646  bile acid:sodium symporter  27.09 
 
 		 297 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571018  normal  0.498047 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1642  bile acid:sodium symporter  26.45 
 
 		 312 aa  45.8  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0689619  normal  0.549741 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2284  Bile acid:sodium symporter  23.83 
 
 		 325 aa  45.8  0.0008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5573  Bile acid:sodium symporter  27.01 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12080  predicted Na+-dependent transporter  25.23 
 
 		 278 aa  45.8  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1736  bile acid transporter family protein  26.62 
 
 		 325 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.764529  normal  0.0499745 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1875  bile acid transporter family protein  21.95 
 
 		 334 aa  45.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.615101  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2047  sodium/bile acid cotransporter family protein  24.69 
 
 		 310 aa  45.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0228  bile acid:sodium symporter  20.75 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0797495  normal  0.303922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3066  bile acid:sodium symporter  26.99 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.567936  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3622  putative transporter  29.27 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0224164  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1763  sodium-dependent transporter  24.6 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00850832  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0369  Bile acid:sodium symporter  24.53 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.379634  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1632  sodium/bile acid transporter family protein  20.4 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2388  bile acid:sodium symporter  22.53 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0056492  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2345  bile acid:sodium symporter  22.53 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000297919  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4216  Bile acid:sodium symporter  25.58 
 
 		 282 aa  42.7  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1482  bile acid:sodium symporter  22.71 
 
 		 280 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.944587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1354  transmembrane transport protein  24.76 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4532  bile acid/sodium symporter  24.18 
 
 		 289 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  0.629454 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0890  Bile acid:sodium symporter  20.16 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5669  Na+-dependent transporter-like protein  28.26 
 
 		 314 aa  42.4  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>