252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2991 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 268 aa  524  1e-148  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  64.88 
 
 		 289 aa  311  9e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.1 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  62.89 
 
 		 274 aa  302  4.0000000000000003e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.6 
 
 		 338 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.15 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.48 
 
 		 359 aa  288  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.32 
 
 		 289 aa  286  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.11 
 
 		 295 aa  286  2.9999999999999996e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.17 
 
 		 293 aa  285  5e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  58.82 
 
 		 309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.23 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.75 
 
 		 283 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  57.42 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  57.42 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  57.42 
 
 		 275 aa  277  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.02 
 
 		 291 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.42 
 
 		 342 aa  276  3e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  59.92 
 
 		 314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  62.26 
 
 		 342 aa  270  1e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  59.52 
 
 		 278 aa  268  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.83 
 
 		 354 aa  268  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  59.11 
 
 		 275 aa  268  7e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.35 
 
 		 322 aa  268  8e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.76 
 
 		 301 aa  264  1e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.18 
 
 		 275 aa  261  6.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.7 
 
 		 303 aa  260  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.26 
 
 		 274 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  59.14 
 
 		 296 aa  256  4e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.6 
 
 		 270 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.16 
 
 		 298 aa  248  7e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  51.53 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.72 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  40.86 
 
 		 304 aa  190  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  34.96 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.1 
 
 		 263 aa  125  6e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  30.86 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  31.54 
 
 		 248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.06 
 
 		 304 aa  115  7.999999999999999e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.07 
 
 		 245 aa  108  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  30.4 
 
 		 247 aa  108  7.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  32.94 
 
 		 247 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  31.87 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  31.87 
 
 		 247 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  32.54 
 
 		 247 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.33 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  32.51 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.63 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  32.67 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.38 
 
 		 267 aa  102  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.4 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  33.63 
 
 		 239 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  32.64 
 
 		 254 aa  99  8e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  32.31 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 		 259 aa  97.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 254 aa  96.3  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 240 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.94 
 
 		 285 aa  95.5  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 285 aa  94.7  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  29.63 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.8 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  29.83 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  28.2 
 
 		 258 aa  92.8  6e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 238 aa  92.4  7e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.08 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  30.36 
 
 		 264 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.88 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  32.05 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.58 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.5 
 
 		 256 aa  90.5  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  31.03 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  30.09 
 
 		 255 aa  87.8  2e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 		 273 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.56 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  40.88 
 
 		 266 aa  85.9  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  34.43 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.22 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  41.18 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  31.58 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.16 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  33.74 
 
 		 272 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  29.17 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.16 
 
 		 272 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.46 
 
 		 257 aa  81.3  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.45 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0342  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.53 
 
 		 248 aa  80.1  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101989  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.68 
 
 		 224 aa  80.5  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.41 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.11 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  37.84 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  29.72 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>