247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2994 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
283 aa  565  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  77.91 
 
 
289 aa  419  1e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  73.46 
 
 
312 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  64.37 
 
 
274 aa  333  2e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.81 
 
 
291 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  64.71 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  58.57 
 
 
309 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.11 
 
 
310 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.36 
 
 
338 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.22 
 
 
322 aa  295  6e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.89 
 
 
359 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 
311 aa  288  9e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.94 
 
 
342 aa  287  2e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  57.55 
 
 
289 aa  286  4e-76  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.68 
 
 
303 aa  285  4e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  60 
 
 
275 aa  279  5e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.67 
 
 
268 aa  266  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  55.98 
 
 
314 aa  265  4e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.05 
 
 
354 aa  261  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.06 
 
 
298 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 
275 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.06 
 
 
295 aa  257  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  52.92 
 
 
278 aa  257  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.26 
 
 
301 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.73 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  53.96 
 
 
296 aa  250  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.67 
 
 
270 aa  248  8e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.08 
 
 
293 aa  248  1e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.16 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.6 
 
 
291 aa  241  7e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  43.64 
 
 
288 aa  223  3e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  41.38 
 
 
304 aa  199  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.04 
 
 
293 aa  198  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  34.75 
 
 
259 aa  132  6e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  35.29 
 
 
313 aa  123  4e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.09 
 
 
263 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.08 
 
 
304 aa  111  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  28.2 
 
 
262 aa  103  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  30 
 
 
248 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 
248 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 
238 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.4 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.32 
 
 
259 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.89 
 
 
275 aa  92.8  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  29.51 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  33.45 
 
 
304 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.35 
 
 
256 aa  90.1  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.39 
 
 
245 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.61 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  31.17 
 
 
296 aa  89.4  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.82 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  30.45 
 
 
272 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  29.34 
 
 
272 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  32.48 
 
 
248 aa  88.6  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  31.18 
 
 
301 aa  88.6  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  29.84 
 
 
272 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.58 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.91 
 
 
224 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.58 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.52 
 
 
295 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.52 
 
 
284 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.39 
 
 
240 aa  86.3  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  30.58 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.43 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  30.04 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  30.04 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  30.04 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  27.63 
 
 
247 aa  85.9  7e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  33.47 
 
 
262 aa  85.9  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 
290 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30.04 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30.04 
 
 
247 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.72 
 
 
261 aa  85.1  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.28 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  29.64 
 
 
276 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  31.23 
 
 
247 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.28 
 
 
285 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  31.37 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 
290 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.6 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  30.71 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.96 
 
 
219 aa  84  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  29.92 
 
 
291 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  30.71 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.2 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.72 
 
 
281 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  26.51 
 
 
243 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  29.8 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>