261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1747 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
267 aa  539  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  55.85 
 
 
264 aa  278  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.13 
 
 
243 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.46 
 
 
251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 
259 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.64 
 
 
254 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.13 
 
 
285 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  40.25 
 
 
243 aa  153  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.8 
 
 
287 aa  151  8.999999999999999e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  37.71 
 
 
243 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  37.71 
 
 
243 aa  151  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.94 
 
 
285 aa  151  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.49 
 
 
281 aa  149  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  37.14 
 
 
245 aa  148  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  36.74 
 
 
279 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  38.65 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  33.98 
 
 
248 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.25 
 
 
295 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.06 
 
 
273 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  38.66 
 
 
296 aa  143  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  36.95 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  35.43 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  35.43 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  35.43 
 
 
247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 
281 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.56 
 
 
236 aa  142  5e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  36.55 
 
 
247 aa  142  5e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  36.55 
 
 
247 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.46 
 
 
273 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.82 
 
 
284 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.69 
 
 
247 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.69 
 
 
247 aa  141  9e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  37.6 
 
 
272 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  37.1 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  33.86 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  37.19 
 
 
272 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  39.66 
 
 
250 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
301 aa  140  3e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.71 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.94 
 
 
261 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.47 
 
 
285 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.4 
 
 
276 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  38.13 
 
 
283 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
249 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.33 
 
 
302 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  36.33 
 
 
302 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 
261 aa  136  4e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.19 
 
 
272 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  34.84 
 
 
276 aa  135  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  35.27 
 
 
239 aa  135  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  40.49 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.8 
 
 
291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  37.39 
 
 
284 aa  133  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  37.08 
 
 
254 aa  133  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  133  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  35.39 
 
 
291 aa  132  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  35.8 
 
 
290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  36.93 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  35.25 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.89 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.58 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  36.89 
 
 
286 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  35.39 
 
 
291 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.1 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.18 
 
 
303 aa  129  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.3 
 
 
282 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  38.68 
 
 
248 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  34.03 
 
 
271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 
290 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.46 
 
 
238 aa  128  9.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  36.4 
 
 
266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 
248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  34.98 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.74 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  36.48 
 
 
283 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  38.62 
 
 
258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  35.27 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  32.93 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.78 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.24 
 
 
297 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 
278 aa  127  3e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  36.4 
 
 
275 aa  127  3e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.02 
 
 
303 aa  126  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  35.54 
 
 
301 aa  125  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  37.96 
 
 
274 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.54 
 
 
291 aa  125  6e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.84 
 
 
276 aa  125  6e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.03 
 
 
262 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.12 
 
 
304 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>