252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4004 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 281 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  96.44 
 
 		 284 aa  520  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  96.09 
 
 		 295 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  92.53 
 
 		 281 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  83.33 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  83.7 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  82.59 
 
 		 272 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  85.29 
 
 		 274 aa  421  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  83.46 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  77.82 
 
 		 284 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  81.9 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  64.36 
 
 		 320 aa  329  4e-89  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  65.87 
 
 		 276 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  64.5 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  58.87 
 
 		 302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.87 
 
 		 302 aa  312  3.9999999999999997e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.4 
 
 		 269 aa  311  9e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.13 
 
 		 301 aa  310  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  67.06 
 
 		 275 aa  310  2e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.6 
 
 		 275 aa  309  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  62.8 
 
 		 279 aa  308  5e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  61.45 
 
 		 266 aa  306  4.0000000000000004e-82  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  61.54 
 
 		 275 aa  303  3.0000000000000004e-81  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.39 
 
 		 285 aa  301  5.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  61.02 
 
 		 304 aa  298  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  60.4 
 
 		 271 aa  291  9e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.25 
 
 		 287 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  55.86 
 
 		 262 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  55.08 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  55.47 
 
 		 262 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.82 
 
 		 285 aa  275  4e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  55.47 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.29 
 
 		 262 aa  275  6e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.37 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.29 
 
 		 262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.09 
 
 		 290 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 262 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.3 
 
 		 291 aa  271  6e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 262 aa  272  6e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 262 aa  271  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.21 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  55.91 
 
 		 291 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  54.21 
 
 		 290 aa  270  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.21 
 
 		 290 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.21 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.21 
 
 		 290 aa  269  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  55.29 
 
 		 262 aa  269  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.79 
 
 		 293 aa  268  5e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.29 
 
 		 262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.48 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.48 
 
 		 290 aa  268  7e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  53.85 
 
 		 291 aa  267  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.57 
 
 		 276 aa  267  2e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.15 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  53.48 
 
 		 291 aa  267  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  53.43 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 262 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.18 
 
 		 286 aa  265  5e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  57.53 
 
 		 301 aa  265  5e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  53.82 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  53.82 
 
 		 263 aa  265  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  57.42 
 
 		 283 aa  265  5.999999999999999e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  56.18 
 
 		 286 aa  265  7e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.91 
 
 		 262 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.25 
 
 		 297 aa  264  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  53.43 
 
 		 296 aa  263  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.33 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.73 
 
 		 262 aa  262  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.35 
 
 		 283 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.64 
 
 		 287 aa  261  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.86 
 
 		 291 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.08 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  56.22 
 
 		 283 aa  255  6e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.92 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.94 
 
 		 303 aa  253  3e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 276 aa  252  5.000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  55.02 
 
 		 266 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  55.86 
 
 		 274 aa  251  1e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  54.12 
 
 		 293 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.44 
 
 		 282 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.63 
 
 		 266 aa  246  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  53.03 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  38.75 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.75 
 
 		 288 aa  169  3e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.75 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.63 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  43.72 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.8 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.39 
 
 		 285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.91 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  40.91 
 
 		 273 aa  159  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  41.1 
 
 		 245 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  40.57 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.73 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>