255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1058 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  100 
 
 		 243 aa  496  1e-139  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  83.54 
 
 		 243 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  83.54 
 
 		 243 aa  427  1e-118  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  43.62 
 
 		 254 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  43.93 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  40.08 
 
 		 247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  40.51 
 
 		 248 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  41.35 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.84 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.75 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.72 
 
 		 285 aa  155  7e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.25 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.41 
 
 		 285 aa  151  8e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.77 
 
 		 301 aa  148  6e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  39.73 
 
 		 279 aa  148  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.19 
 
 		 251 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.05 
 
 		 269 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  36.99 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  37.07 
 
 		 275 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.92 
 
 		 273 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.19 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  39.06 
 
 		 266 aa  141  8e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  35.54 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  38.82 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  41.08 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.18 
 
 		 284 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.02 
 
 		 287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.18 
 
 		 295 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.45 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.87 
 
 		 281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  39.48 
 
 		 284 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  36.64 
 
 		 275 aa  138  7e-32  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.04 
 
 		 276 aa  138  7e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  37.02 
 
 		 272 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.02 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  36.82 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  36.64 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.82 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  36.6 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.44 
 
 		 285 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  37.77 
 
 		 296 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.32 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  38.66 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  36.48 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.11 
 
 		 259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.5 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  37.77 
 
 		 250 aa  132  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.51 
 
 		 287 aa  132  5e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.33 
 
 		 247 aa  132  6e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.34 
 
 		 262 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 262 aa  131  9e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  37.23 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  37.23 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  36.91 
 
 		 304 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  36.55 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.78 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.17 
 
 		 275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  34.4 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.63 
 
 		 276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.93 
 
 		 272 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.86 
 
 		 285 aa  129  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  33.05 
 
 		 242 aa  128  6e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.32 
 
 		 261 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.63 
 
 		 262 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  33.19 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  33.77 
 
 		 254 aa  126  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.05 
 
 		 283 aa  126  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.87 
 
 		 274 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.77 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  36.93 
 
 		 301 aa  124  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  34.05 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  39.24 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.29 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.18 
 
 		 296 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.6 
 
 		 245 aa  122  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.2 
 
 		 239 aa  122  7e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.05 
 
 		 297 aa  121  8e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  33.91 
 
 		 293 aa  119  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.77 
 
 		 262 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  37.02 
 
 		 274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.48 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>