255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5641 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
285 aa  566  1e-160  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.38 
 
 
285 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.64 
 
 
285 aa  186  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  45.12 
 
 
254 aa  185  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.87 
 
 
273 aa  183  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.56 
 
 
300 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.45 
 
 
299 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.45 
 
 
299 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  44.13 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  40.89 
 
 
245 aa  162  6e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.3 
 
 
269 aa  155  6e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.61 
 
 
273 aa  155  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.84 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  39.69 
 
 
249 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  37.89 
 
 
279 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  38.06 
 
 
275 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  36.96 
 
 
243 aa  148  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.8 
 
 
285 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.45 
 
 
248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  37.96 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.68 
 
 
283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  38.52 
 
 
266 aa  147  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  40.55 
 
 
276 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.01 
 
 
248 aa  145  8.000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.37 
 
 
254 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  38.43 
 
 
271 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.22 
 
 
267 aa  143  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  39.18 
 
 
304 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  37.6 
 
 
302 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.6 
 
 
302 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  39.53 
 
 
275 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.43 
 
 
262 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  35.8 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  35.8 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  35.91 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.2 
 
 
285 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.93 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  37.3 
 
 
293 aa  139  7e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.11 
 
 
297 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  34.72 
 
 
248 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.5 
 
 
303 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.97 
 
 
251 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.07 
 
 
275 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.32 
 
 
276 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.22 
 
 
295 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.22 
 
 
284 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.68 
 
 
282 aa  136  4e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.72 
 
 
301 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
247 aa  136  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.51 
 
 
275 aa  136  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.02 
 
 
303 aa  135  5e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  35.91 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  35.91 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.22 
 
 
281 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  35.52 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  35.52 
 
 
247 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.51 
 
 
276 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.29 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  38.31 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  37.7 
 
 
283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  36.76 
 
 
266 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.7 
 
 
287 aa  133  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  38.17 
 
 
263 aa  133  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  37.9 
 
 
250 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  36.11 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  35.91 
 
 
272 aa  132  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  35.91 
 
 
272 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  37.25 
 
 
274 aa  132  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  37.3 
 
 
284 aa  132  7.999999999999999e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  36.11 
 
 
283 aa  132  7.999999999999999e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.11 
 
 
286 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  33.73 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  34.94 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.32 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.71 
 
 
290 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.73 
 
 
287 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.12 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.12 
 
 
262 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  33.73 
 
 
262 aa  129  6e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.12 
 
 
262 aa  129  6e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.32 
 
 
290 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.32 
 
 
287 aa  128  8.000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  34.36 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  35.34 
 
 
290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.73 
 
 
293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.32 
 
 
291 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  32.13 
 
 
296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.12 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.94 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  33.73 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.94 
 
 
290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  33.73 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  32.94 
 
 
262 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.04 
 
 
266 aa  127  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.39 
 
 
262 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>