258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1134 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 247 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  42.91 
 
 		 254 aa  181  8.000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.77 
 
 		 261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  43.15 
 
 		 248 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  176  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  43.57 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.46 
 
 		 267 aa  169  3e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  42.21 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 		 281 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.56 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  41.74 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  41.74 
 
 		 272 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.92 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.09 
 
 		 295 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  42.15 
 
 		 272 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.09 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 285 aa  157  2e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.53 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.25 
 
 		 287 aa  155  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.58 
 
 		 285 aa  154  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.39 
 
 		 243 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  37.6 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  40.26 
 
 		 245 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 		 240 aa  151  8.999999999999999e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.05 
 
 		 236 aa  150  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.25 
 
 		 273 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  42.8 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.8 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  38.37 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  38.21 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  39.83 
 
 		 275 aa  149  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  35.25 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  35.25 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  41.3 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  39.33 
 
 		 276 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  36.78 
 
 		 239 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  35.94 
 
 		 248 aa  145  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  40.51 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  36.71 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  40.91 
 
 		 283 aa  143  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.76 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  39.33 
 
 		 266 aa  142  5e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.99 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.41 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.51 
 
 		 290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  40.42 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 290 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  37.55 
 
 		 258 aa  139  6e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  36.59 
 
 		 255 aa  139  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  40.59 
 
 		 286 aa  138  7e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.25 
 
 		 297 aa  138  7.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  40 
 
 		 271 aa  138  1e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  40.17 
 
 		 266 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  40.59 
 
 		 293 aa  138  1e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  41.32 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.66 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.08 
 
 		 291 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.66 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.24 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.16 
 
 		 285 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  37.24 
 
 		 283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  39.08 
 
 		 296 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  39.42 
 
 		 284 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  39.75 
 
 		 296 aa  135  4e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  39.24 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 243 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 303 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.17 
 
 		 282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.18 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 293 aa  135  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.66 
 
 		 287 aa  135  7.000000000000001e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  38.91 
 
 		 250 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.89 
 
 		 266 aa  135  8e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 293 aa  135  8e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.75 
 
 		 276 aa  134  9.999999999999999e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>