260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2584 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 259 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  42.86 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  43.08 
 
 		 248 aa  166  5e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  42.75 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  42.75 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  42.75 
 
 		 247 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  41.06 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  42.35 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  42.35 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  42.35 
 
 		 247 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  41.96 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  41.96 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.73 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  40.38 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  41.47 
 
 		 249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.8 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.64 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.78 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.47 
 
 		 287 aa  142  4e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  37.5 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  39.43 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  35.1 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.04 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  36.51 
 
 		 276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.1 
 
 		 243 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  38.87 
 
 		 263 aa  138  8.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.52 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  37.13 
 
 		 254 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.61 
 
 		 273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.25 
 
 		 297 aa  135  5e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  36.63 
 
 		 275 aa  135  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.86 
 
 		 281 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.84 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  35.8 
 
 		 266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.3 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.63 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  38.11 
 
 		 243 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.94 
 
 		 281 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.34 
 
 		 301 aa  132  6.999999999999999e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.9 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.14 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.9 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  35.97 
 
 		 283 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.86 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  40.65 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  37.45 
 
 		 243 aa  129  3e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  37.04 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  35.42 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  35.63 
 
 		 272 aa  129  6e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  34.41 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.15 
 
 		 272 aa  128  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  36.36 
 
 		 286 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  36.67 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.52 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  38.55 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.34 
 
 		 240 aa  127  2.0000000000000002e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.55 
 
 		 302 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.74 
 
 		 283 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  34.36 
 
 		 248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 276 aa  125  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.1 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  34.1 
 
 		 262 aa  125  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  34.88 
 
 		 248 aa  125  6e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  35.6 
 
 		 301 aa  125  9e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 		 287 aa  124  1e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  35.8 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  35.22 
 
 		 284 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.07 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.14 
 
 		 282 aa  123  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.15 
 
 		 285 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  34.54 
 
 		 262 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  34.57 
 
 		 283 aa  123  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  34.43 
 
 		 283 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.54 
 
 		 248 aa  123  3e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  35.22 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35.41 
 
 		 279 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.07 
 
 		 290 aa  122  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  34.14 
 
 		 262 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  36.07 
 
 		 291 aa  122  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.94 
 
 		 296 aa  122  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  35.12 
 
 		 293 aa  122  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  35.66 
 
 		 291 aa  121  9e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  35.8 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  34.14 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.41 
 
 		 276 aa  120  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.25 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>