255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1317 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 248 aa  482  1e-135  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.5 
 
 		 241 aa  166  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  42.73 
 
 		 245 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  40.93 
 
 		 248 aa  159  4e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  39.58 
 
 		 239 aa  159  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  37.08 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.71 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.43 
 
 		 285 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  36.1 
 
 		 262 aa  152  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 245 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  40.85 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 285 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  38.06 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  38.46 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  38.46 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.21 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  37.65 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  37.65 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  37.65 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  37.65 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  37.4 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  37.4 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.92 
 
 		 287 aa  148  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  40.73 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  37.25 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  38.86 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.19 
 
 		 302 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  44.19 
 
 		 302 aa  144  9e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.55 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.35 
 
 		 272 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  44.34 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.45 
 
 		 273 aa  142  6e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  39.32 
 
 		 249 aa  141  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  40.89 
 
 		 263 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.22 
 
 		 285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.31 
 
 		 248 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.2 
 
 		 261 aa  139  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.38 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  43.26 
 
 		 279 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.33 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.82 
 
 		 285 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37 
 
 		 251 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.71 
 
 		 238 aa  131  7.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.15 
 
 		 273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  34.47 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  34.47 
 
 		 243 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  41.89 
 
 		 304 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.4 
 
 		 261 aa  129  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.45 
 
 		 275 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  39.55 
 
 		 271 aa  128  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 		 300 aa  128  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  33.19 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.74 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  38.36 
 
 		 275 aa  125  6e-28  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  39.55 
 
 		 272 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.55 
 
 		 281 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  39.55 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  40.54 
 
 		 275 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  38.36 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.45 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  38.53 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.45 
 
 		 295 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.09 
 
 		 284 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.09 
 
 		 281 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.84 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.84 
 
 		 299 aa  123  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  41.18 
 
 		 286 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.39 
 
 		 287 aa  122  6e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.95 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.77 
 
 		 236 aa  121  8e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.74 
 
 		 240 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.72 
 
 		 286 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.81 
 
 		 269 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  36.24 
 
 		 301 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  35.37 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  33.19 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.73 
 
 		 272 aa  118  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.46 
 
 		 282 aa  118  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  39.01 
 
 		 266 aa  118  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.74 
 
 		 303 aa  118  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  40.91 
 
 		 284 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  37.39 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  36.84 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.29 
 
 		 283 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.46 
 
 		 290 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  37.39 
 
 		 263 aa  116  3e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  40.45 
 
 		 283 aa  116  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.64 
 
 		 278 aa  115  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  38.91 
 
 		 291 aa  115  5e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.46 
 
 		 276 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  35.16 
 
 		 282 aa  115  7.999999999999999e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.96 
 
 		 293 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  38.46 
 
 		 290 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.56 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  37.56 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.96 
 
 		 293 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.73 
 
 		 275 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  38.46 
 
 		 291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>