257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2758 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
248 aa  502  1e-141  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.96 
 
 
285 aa  203  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.96 
 
 
285 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  48.21 
 
 
245 aa  196  3e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  43.16 
 
 
254 aa  191  8e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.44 
 
 
273 aa  188  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.06 
 
 
272 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  44.26 
 
 
266 aa  181  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.68 
 
 
273 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.15 
 
 
238 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.62 
 
 
300 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  37.83 
 
 
275 aa  151  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.07 
 
 
285 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  36.36 
 
 
275 aa  148  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.89 
 
 
285 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.08 
 
 
303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.36 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 
275 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  37.39 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.12 
 
 
276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  35.5 
 
 
266 aa  145  4.0000000000000006e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  35.22 
 
 
276 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.45 
 
 
285 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  36.02 
 
 
271 aa  144  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.12 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  41.48 
 
 
301 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 
262 aa  143  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.35 
 
 
262 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.9 
 
 
262 aa  142  4e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.68 
 
 
281 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.87 
 
 
286 aa  142  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.78 
 
 
297 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  38.22 
 
 
286 aa  142  5e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 
262 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 
262 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.68 
 
 
275 aa  142  6e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  36.68 
 
 
272 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 
299 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 
299 aa  142  7e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  38.43 
 
 
296 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  36.68 
 
 
272 aa  141  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  38.08 
 
 
283 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.31 
 
 
248 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.25 
 
 
262 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  38.71 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  38.5 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  37.84 
 
 
284 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  38.71 
 
 
262 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  38.71 
 
 
262 aa  139  6e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.05 
 
 
262 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  37.33 
 
 
283 aa  139  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.81 
 
 
295 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.81 
 
 
284 aa  138  7e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  38.71 
 
 
262 aa  138  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.73 
 
 
287 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 
262 aa  138  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.37 
 
 
281 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.96 
 
 
262 aa  137  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  37.07 
 
 
301 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  36.29 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.29 
 
 
302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  35.24 
 
 
263 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35 
 
 
251 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  36.75 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.2 
 
 
269 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  36.75 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  9e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  36.12 
 
 
279 aa  135  9e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  37.5 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 
282 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.32 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  33.76 
 
 
282 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.78 
 
 
293 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.62 
 
 
301 aa  133  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  35.34 
 
 
254 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.29 
 
 
283 aa  133  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.76 
 
 
287 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  35.47 
 
 
263 aa  131  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  35.9 
 
 
247 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  33.18 
 
 
239 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  35.47 
 
 
263 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  35.34 
 
 
296 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  36.68 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  35.12 
 
 
293 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.63 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.65 
 
 
278 aa  130  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  34.86 
 
 
255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.17 
 
 
303 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.95 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  36.4 
 
 
293 aa  129  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 
245 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  35.93 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  36 
 
 
291 aa  128  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>