250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3030 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 282 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  80.36 
 
 		 293 aa  449  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  80.38 
 
 		 278 aa  442  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  82.77 
 
 		 286 aa  437  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  83.15 
 
 		 286 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  82.02 
 
 		 276 aa  434  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.68 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  80.84 
 
 		 283 aa  426  1e-118  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.71 
 
 		 283 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  83.33 
 
 		 283 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.32 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.16 
 
 		 290 aa  411  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.94 
 
 		 290 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  76.32 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.94 
 
 		 290 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.94 
 
 		 290 aa  408  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  75.94 
 
 		 291 aa  407  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.56 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  75.19 
 
 		 290 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.34 
 
 		 291 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.56 
 
 		 290 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  74.91 
 
 		 303 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  73.98 
 
 		 296 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  73.21 
 
 		 291 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  75.47 
 
 		 301 aa  403  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  70.76 
 
 		 293 aa  398  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  70.76 
 
 		 293 aa  397  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  69.68 
 
 		 293 aa  395  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.42 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.05 
 
 		 291 aa  352  2.9999999999999997e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  66.27 
 
 		 283 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.29 
 
 		 276 aa  311  7.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.4 
 
 		 303 aa  306  2.0000000000000002e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  63.24 
 
 		 274 aa  293  2e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  61.35 
 
 		 266 aa  292  5e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  52.83 
 
 		 304 aa  259  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  55.85 
 
 		 284 aa  255  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  55.78 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  56.13 
 
 		 276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 281 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.63 
 
 		 269 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.44 
 
 		 281 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  56.3 
 
 		 296 aa  249  5e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 284 aa  247  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.4 
 
 		 285 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 295 aa  246  3e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.52 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  55.2 
 
 		 275 aa  245  6e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.57 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  52.57 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  52.71 
 
 		 272 aa  244  8e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  52.71 
 
 		 272 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.36 
 
 		 275 aa  241  7e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.75 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.2 
 
 		 285 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50 
 
 		 262 aa  239  5e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.28 
 
 		 262 aa  238  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  52.19 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.18 
 
 		 287 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  56.4 
 
 		 274 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.36 
 
 		 262 aa  232  6e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.18 
 
 		 262 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  49.44 
 
 		 320 aa  231  8.000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  51 
 
 		 266 aa  228  7e-59  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  50 
 
 		 275 aa  228  9e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.22 
 
 		 262 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.2 
 
 		 262 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  47.24 
 
 		 262 aa  224  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  47.24 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  47.24 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.22 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  46.74 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.22 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.22 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  46.85 
 
 		 262 aa  223  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.83 
 
 		 262 aa  221  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.83 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  49.02 
 
 		 263 aa  219  3.9999999999999997e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  49.6 
 
 		 263 aa  219  5e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  54.78 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.99 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.75 
 
 		 285 aa  176  3e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.14 
 
 		 285 aa  176  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.8 
 
 		 273 aa  162  7e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  41.3 
 
 		 245 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.25 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  40.08 
 
 		 273 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  41.84 
 
 		 254 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  35.46 
 
 		 288 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.69 
 
 		 273 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.39 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  39.11 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>