260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2261 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  93.02 
 
 
301 aa  505  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  85.98 
 
 
300 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 
285 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 
285 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 
273 aa  187  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  43.19 
 
 
254 aa  177  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.45 
 
 
285 aa  176  4e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.56 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  40.71 
 
 
245 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.86 
 
 
273 aa  155  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.67 
 
 
248 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  44.44 
 
 
266 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.84 
 
 
248 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  38.84 
 
 
275 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.1 
 
 
254 aa  133  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40 
 
 
282 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.7 
 
 
276 aa  132  6e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.96 
 
 
287 aa  131  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.24 
 
 
257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.44 
 
 
303 aa  130  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.33 
 
 
283 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  37.61 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.33 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  37.33 
 
 
286 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  37.44 
 
 
283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.78 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.71 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  40.09 
 
 
249 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  34.67 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  36.55 
 
 
247 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  37.34 
 
 
276 aa  126  5e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  35.98 
 
 
243 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.08 
 
 
261 aa  125  9e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  34.67 
 
 
296 aa  124  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 
297 aa  125  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  34.89 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  35.37 
 
 
272 aa  124  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  34.89 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  35.29 
 
 
247 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  34.35 
 
 
301 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.17 
 
 
251 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  36.96 
 
 
283 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  33.62 
 
 
272 aa  123  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.4 
 
 
285 aa  124  3e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  33.62 
 
 
272 aa  122  5e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  36.89 
 
 
293 aa  123  5e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.28 
 
 
281 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.67 
 
 
293 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  35.24 
 
 
293 aa  122  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  36.09 
 
 
263 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  34.87 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  34.89 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  34.89 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  34.89 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  34.87 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  34.87 
 
 
247 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.84 
 
 
284 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.33 
 
 
287 aa  122  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.84 
 
 
295 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 
293 aa  121  9.999999999999999e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  37.39 
 
 
274 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.28 
 
 
281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.98 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 
261 aa  119  6e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.75 
 
 
269 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  34.65 
 
 
275 aa  119  7e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 
303 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  36.96 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.67 
 
 
278 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  34.44 
 
 
304 aa  118  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  35.93 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  33.98 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  35.5 
 
 
235 aa  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.67 
 
 
275 aa  117  3e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.04 
 
 
267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.91 
 
 
287 aa  116  5e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.22 
 
 
275 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.89 
 
 
291 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.11 
 
 
290 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  34.22 
 
 
283 aa  114  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  34.06 
 
 
296 aa  114  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  34.76 
 
 
243 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  34.76 
 
 
243 aa  113  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.03 
 
 
242 aa  113  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 
262 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  30.64 
 
 
262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.48 
 
 
291 aa  112  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 
262 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.12 
 
 
262 aa  112  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  34.65 
 
 
264 aa  112  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  37.23 
 
 
279 aa  112  8.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  33.48 
 
 
290 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>