252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1256 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 274 aa  539  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.2 
 
 		 290 aa  316  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.8 
 
 		 290 aa  315  4e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.8 
 
 		 290 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.8 
 
 		 290 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  64.4 
 
 		 290 aa  314  8e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  63.78 
 
 		 296 aa  314  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.81 
 
 		 293 aa  314  9.999999999999999e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.4 
 
 		 290 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  64.57 
 
 		 301 aa  313  1.9999999999999998e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.42 
 
 		 293 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64 
 
 		 290 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64 
 
 		 290 aa  311  4.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  64 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  63.2 
 
 		 291 aa  310  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  63.04 
 
 		 293 aa  309  2e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.2 
 
 		 291 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  63.6 
 
 		 291 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.24 
 
 		 282 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.03 
 
 		 276 aa  299  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.07 
 
 		 283 aa  297  1e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.02 
 
 		 287 aa  296  2e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.24 
 
 		 291 aa  295  4e-79  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.18 
 
 		 276 aa  295  6e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  60.78 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.39 
 
 		 278 aa  293  2e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.39 
 
 		 303 aa  292  3e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  61.6 
 
 		 283 aa  292  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  62.3 
 
 		 283 aa  291  1e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.6 
 
 		 286 aa  288  7e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  61.6 
 
 		 286 aa  288  8e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  56.54 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.24 
 
 		 297 aa  285  5e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  58.66 
 
 		 266 aa  280  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.13 
 
 		 303 aa  279  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  56.27 
 
 		 275 aa  266  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  56.13 
 
 		 279 aa  263  3e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  56.49 
 
 		 284 aa  260  2e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.34 
 
 		 301 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.69 
 
 		 281 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.86 
 
 		 281 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  55.6 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.18 
 
 		 269 aa  255  5e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  51.85 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.08 
 
 		 284 aa  251  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  53.75 
 
 		 272 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.08 
 
 		 295 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  53.75 
 
 		 272 aa  250  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  54.75 
 
 		 296 aa  247  2e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.55 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  50.55 
 
 		 302 aa  245  4.9999999999999997e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.94 
 
 		 285 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  52 
 
 		 304 aa  243  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.41 
 
 		 285 aa  242  5e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  51.57 
 
 		 271 aa  241  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.36 
 
 		 275 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  52.19 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  52.19 
 
 		 266 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  57.31 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.99 
 
 		 275 aa  235  7e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  48.84 
 
 		 263 aa  231  1e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  48.84 
 
 		 263 aa  230  2e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.37 
 
 		 287 aa  229  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.19 
 
 		 262 aa  228  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.61 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.66 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.61 
 
 		 262 aa  224  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.61 
 
 		 262 aa  223  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.61 
 
 		 262 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.22 
 
 		 262 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  48.66 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.95 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  48.05 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  48.66 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  48.05 
 
 		 262 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  50.2 
 
 		 320 aa  219  3e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.08 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.56 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  48.25 
 
 		 262 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  53.88 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.24 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.97 
 
 		 266 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.91 
 
 		 285 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  41.81 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.55 
 
 		 315 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.17 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.89 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  40.89 
 
 		 273 aa  148  8e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.19 
 
 		 288 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  37.6 
 
 		 288 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  39.22 
 
 		 254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  39.92 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  41.38 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>