256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_0132 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
242 aa  487  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  71.01 
 
 
245 aa  357  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  63.03 
 
 
255 aa  310  9e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  62.61 
 
 
239 aa  310  1e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.08 
 
 
241 aa  302  3.0000000000000004e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  56.73 
 
 
248 aa  264  1e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  38.43 
 
 
262 aa  162  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.71 
 
 
248 aa  157  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  37.61 
 
 
254 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.84 
 
 
260 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  36.21 
 
 
247 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  35.6 
 
 
254 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 
285 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  36.59 
 
 
248 aa  142  7e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 
285 aa  141  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.48 
 
 
247 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.48 
 
 
247 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  37.04 
 
 
247 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  36.63 
 
 
247 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  36.63 
 
 
247 aa  138  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  37.5 
 
 
271 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  38.53 
 
 
245 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.13 
 
 
273 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  35.47 
 
 
275 aa  135  8e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 
276 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.09 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.31 
 
 
251 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.73 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.34 
 
 
285 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.35 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32 
 
 
236 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  36.73 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 
240 aa  124  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.48 
 
 
248 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  35.41 
 
 
249 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.56 
 
 
261 aa  123  3e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  34.68 
 
 
279 aa  123  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 
295 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 
281 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 
284 aa  122  6e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  34.31 
 
 
266 aa  121  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.59 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.32 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  32.64 
 
 
283 aa  119  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  31.43 
 
 
275 aa  120  3e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 
287 aa  119  3.9999999999999996e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.74 
 
 
303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.17 
 
 
273 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.16 
 
 
285 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.34 
 
 
301 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  30.42 
 
 
272 aa  118  9e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  32.48 
 
 
243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  30.61 
 
 
266 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.91 
 
 
302 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.37 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  31.91 
 
 
302 aa  117  9.999999999999999e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.93 
 
 
276 aa  117  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  36.82 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.62 
 
 
303 aa  117  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.83 
 
 
283 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.63 
 
 
275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  29.58 
 
 
272 aa  115  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.83 
 
 
272 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  34.75 
 
 
248 aa  115  6e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  29.24 
 
 
291 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  30.34 
 
 
283 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  34.75 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  32.07 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  31.95 
 
 
259 aa  114  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  32.07 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.96 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 
293 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  31.33 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.91 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.24 
 
 
291 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 
281 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  34.63 
 
 
282 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.56 
 
 
243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 
259 aa  112  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.91 
 
 
315 aa  112  5e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  31.8 
 
 
284 aa  112  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  31.9 
 
 
288 aa  112  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.82 
 
 
238 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 
286 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 
290 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  32.89 
 
 
247 aa  111  8.000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 
290 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 
282 aa  111  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.45 
 
 
291 aa  111  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  29.49 
 
 
283 aa  111  9e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  30.08 
 
 
290 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  29.49 
 
 
286 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.66 
 
 
290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.66 
 
 
291 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>