255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1774 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  100 
 
 		 248 aa  486  1e-136  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  98.79 
 
 		 248 aa  483  1e-135  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  40.56 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.99 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.08 
 
 		 285 aa  143  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  36.84 
 
 		 242 aa  139  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.67 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.62 
 
 		 273 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  38.21 
 
 		 248 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.3 
 
 		 272 aa  135  8e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  35.27 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  34.45 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  36.89 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  34.03 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  36.89 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  37.3 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  36.89 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.27 
 
 		 267 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.93 
 
 		 240 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.89 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.89 
 
 		 247 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  30.65 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  36.48 
 
 		 272 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  35.19 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.9 
 
 		 276 aa  125  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.12 
 
 		 261 aa  125  6e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  34.91 
 
 		 272 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.44 
 
 		 273 aa  125  8.000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  31.4 
 
 		 271 aa  124  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.62 
 
 		 281 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  33.2 
 
 		 263 aa  123  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  35.66 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 275 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.19 
 
 		 295 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.19 
 
 		 284 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  29.51 
 
 		 259 aa  122  5e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.98 
 
 		 311 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.17 
 
 		 359 aa  122  7e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.11 
 
 		 259 aa  121  8e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  35.2 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  33.62 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.76 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  38.03 
 
 		 258 aa  120  3e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  32.76 
 
 		 275 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  35.56 
 
 		 296 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.58 
 
 		 342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.84 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.54 
 
 		 261 aa  118  7e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 		 269 aa  119  7e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.51 
 
 		 287 aa  118  7.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  32.76 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  33.89 
 
 		 250 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.36 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  28.74 
 
 		 289 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.97 
 
 		 291 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0307  segregation and condensation protein A  36.33 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  34.02 
 
 		 284 aa  115  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  28.22 
 
 		 274 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.75 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.94 
 
 		 291 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 		 262 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.19 
 
 		 285 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.61 
 
 		 301 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.33 
 
 		 275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.49 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.96 
 
 		 285 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  31.82 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  30.17 
 
 		 262 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.69 
 
 		 254 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  31.9 
 
 		 320 aa  111  9e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.93 
 
 		 263 aa  111  9e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 		 303 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.47 
 
 		 282 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.51 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.74 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 		 257 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  33.05 
 
 		 274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 		 286 aa  110  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 		 303 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.62 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  29.74 
 
 		 262 aa  110  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  30.96 
 
 		 262 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  29.74 
 
 		 262 aa  109  5e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  29.05 
 
 		 279 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  31.9 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  31.03 
 
 		 286 aa  108  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.77 
 
 		 288 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>