260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06800 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  630  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  52.67 
 
 
259 aa  264  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.08 
 
 
263 aa  255  8e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.25 
 
 
304 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  36.99 
 
 
248 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  35.77 
 
 
247 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  34.69 
 
 
309 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 
295 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 
281 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  136  5e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  136  5e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  136  5e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.52 
 
 
284 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.68 
 
 
291 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.55 
 
 
281 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  35.77 
 
 
247 aa  135  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  35.77 
 
 
247 aa  135  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  35.98 
 
 
272 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  35.56 
 
 
272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  36.18 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  35.15 
 
 
272 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  38.43 
 
 
254 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  34.68 
 
 
274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.42 
 
 
289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.55 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.8 
 
 
312 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  30.65 
 
 
248 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  30.65 
 
 
248 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.15 
 
 
359 aa  126  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  32.13 
 
 
289 aa  125  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  36.59 
 
 
249 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  31.5 
 
 
288 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  34.71 
 
 
342 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.79 
 
 
293 aa  124  2e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  35.98 
 
 
274 aa  122  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.78 
 
 
291 aa  122  6e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  35.82 
 
 
304 aa  121  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.13 
 
 
322 aa  121  9.999999999999999e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 
354 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.03 
 
 
287 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  36.13 
 
 
284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  36.25 
 
 
254 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.15 
 
 
268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.43 
 
 
285 aa  116  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  33.62 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.72 
 
 
338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  33.9 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  31.8 
 
 
275 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  31.25 
 
 
314 aa  113  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.45 
 
 
342 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.3 
 
 
311 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  35.02 
 
 
275 aa  113  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  33.89 
 
 
296 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.37 
 
 
310 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.29 
 
 
283 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.15 
 
 
285 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.56 
 
 
285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.2 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.83 
 
 
273 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.03 
 
 
261 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.89 
 
 
262 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  30.18 
 
 
264 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  33.9 
 
 
262 aa  108  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.54 
 
 
295 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  31.15 
 
 
248 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.76 
 
 
270 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 
290 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 
262 aa  107  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 
276 aa  108  2e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.96 
 
 
262 aa  107  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 
262 aa  107  3e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 
262 aa  107  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 
290 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
290 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 
290 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.71 
 
 
275 aa  107  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.69 
 
 
257 aa  106  5e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.05 
 
 
303 aa  106  5e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  32.08 
 
 
275 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.65 
 
 
279 aa  106  6e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  32.08 
 
 
275 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  32.08 
 
 
275 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 
262 aa  105  9e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  33.91 
 
 
245 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  30.71 
 
 
278 aa  105  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 
290 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.03 
 
 
248 aa  105  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.17 
 
 
298 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  30.89 
 
 
296 aa  105  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  31.06 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  31.06 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  32.48 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  31.06 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  31.06 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.12 
 
 
261 aa  104  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  30.2 
 
 
263 aa  104  2e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  31.06 
 
 
291 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>