233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1930 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
322 aa  624  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.9 
 
 
312 aa  327  1.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  64.26 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.49 
 
 
303 aa  326  3e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  59.27 
 
 
309 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.6 
 
 
289 aa  306  3e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.88 
 
 
338 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  57.86 
 
 
274 aa  295  8e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.22 
 
 
293 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.52 
 
 
359 aa  285  7e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.76 
 
 
291 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  58.76 
 
 
296 aa  278  8e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.63 
 
 
283 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.92 
 
 
310 aa  273  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.99 
 
 
298 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.77 
 
 
270 aa  271  2e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  59.64 
 
 
275 aa  270  2e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  57.94 
 
 
289 aa  265  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.83 
 
 
342 aa  265  8.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.35 
 
 
268 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.94 
 
 
354 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.1 
 
 
311 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  53.9 
 
 
314 aa  249  5e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.98 
 
 
295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.57 
 
 
291 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  52.27 
 
 
288 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  51.91 
 
 
275 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  51.91 
 
 
275 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  51.91 
 
 
275 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  52.24 
 
 
278 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.57 
 
 
275 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.85 
 
 
293 aa  215  9.999999999999999e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.37 
 
 
301 aa  210  3e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.94 
 
 
274 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  39.8 
 
 
304 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.58 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  34.13 
 
 
313 aa  129  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.05 
 
 
263 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.2 
 
 
241 aa  109  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.6 
 
 
304 aa  108  2e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 
242 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.93 
 
 
245 aa  105  9e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  29.25 
 
 
243 aa  99.8  6e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25 
 
 
243 aa  99.4  8e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  27.38 
 
 
262 aa  99  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.62 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  32.17 
 
 
248 aa  97.8  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.16 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.76 
 
 
238 aa  94.7  2e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.16 
 
 
236 aa  92.4  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  28.76 
 
 
255 aa  91.3  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  30.68 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  30.77 
 
 
283 aa  89.7  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  31.47 
 
 
301 aa  89  9e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 
293 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.92 
 
 
287 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.36 
 
 
290 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 
290 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.48 
 
 
251 aa  86.3  7e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  29.27 
 
 
290 aa  85.9  8e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.36 
 
 
291 aa  85.9  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.64 
 
 
285 aa  85.9  9e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  29.27 
 
 
291 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  27.91 
 
 
247 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  25.68 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.86 
 
 
290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.86 
 
 
290 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  29.92 
 
 
293 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 
297 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  30.71 
 
 
266 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  28.86 
 
 
291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  25.68 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.74 
 
 
272 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 
267 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.08 
 
 
254 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 
248 aa  84  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  27.8 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  26.74 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  26.74 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  29.27 
 
 
283 aa  83.2  0.000000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.43 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.78 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.46 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  26.32 
 
 
242 aa  82.4  0.000000000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  27.8 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.29 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.29 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.19 
 
 
254 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>