250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2155 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
303 aa  585  1e-166  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.49 
 
 
322 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.98 
 
 
338 aa  317  1e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  66.67 
 
 
342 aa  308  9e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.3 
 
 
289 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  56.95 
 
 
309 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.61 
 
 
312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.18 
 
 
310 aa  299  5e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.58 
 
 
298 aa  297  1e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.83 
 
 
359 aa  292  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.35 
 
 
293 aa  285  7e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.51 
 
 
291 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  55.26 
 
 
274 aa  273  3e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.12 
 
 
342 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  59.29 
 
 
289 aa  270  2.9999999999999997e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  61.33 
 
 
296 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.3 
 
 
270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.19 
 
 
311 aa  265  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.68 
 
 
283 aa  265  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.6 
 
 
295 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.8 
 
 
354 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  60.08 
 
 
314 aa  259  4e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  55.51 
 
 
275 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.4 
 
 
268 aa  250  3e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  54.88 
 
 
275 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  54.88 
 
 
275 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  54.88 
 
 
275 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  50.96 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.49 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.18 
 
 
275 aa  236  3e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  55.1 
 
 
278 aa  233  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.94 
 
 
301 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.54 
 
 
274 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.9 
 
 
293 aa  201  9e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  37.72 
 
 
304 aa  166  4e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  31.69 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.86 
 
 
263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 
304 aa  113  3e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.15 
 
 
267 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.82 
 
 
245 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  30.42 
 
 
313 aa  106  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  26.94 
 
 
248 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.32 
 
 
248 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.6 
 
 
240 aa  102  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.31 
 
 
285 aa  102  7e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.63 
 
 
241 aa  102  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  28.81 
 
 
247 aa  102  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.44 
 
 
285 aa  100  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  32.38 
 
 
296 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.9 
 
 
243 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
291 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 
242 aa  100  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  32.91 
 
 
291 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.49 
 
 
291 aa  99.4  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.39 
 
 
303 aa  99.4  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 
273 aa  99  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.65 
 
 
290 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  32.79 
 
 
301 aa  98.2  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.49 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  32.07 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  32.07 
 
 
291 aa  98.2  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.49 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.49 
 
 
290 aa  97.1  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  32.07 
 
 
283 aa  97.4  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.28 
 
 
251 aa  95.9  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.07 
 
 
290 aa  95.9  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.84 
 
 
303 aa  95.9  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 
275 aa  95.9  8e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.07 
 
 
290 aa  95.5  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 
243 aa  95.1  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  31.43 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  30.22 
 
 
239 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.24 
 
 
293 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.05 
 
 
293 aa  91.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.89 
 
 
256 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.05 
 
 
236 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  30.86 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.4 
 
 
282 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  28.51 
 
 
254 aa  90.5  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  25.94 
 
 
242 aa  89.4  7e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.98 
 
 
238 aa  89.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  27.27 
 
 
248 aa  89  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  27.24 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  32.3 
 
 
254 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.98 
 
 
278 aa  88.6  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  33.62 
 
 
266 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  27.24 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.09 
 
 
275 aa  88.6  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  23.23 
 
 
262 aa  87.8  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  30.38 
 
 
283 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  28.06 
 
 
248 aa  87.4  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  28.63 
 
 
275 aa  86.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.38 
 
 
295 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>