248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 342 aa  662    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.94 
 
 		 322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.34 
 
 		 289 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  58.7 
 
 		 309 aa  310  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.6 
 
 		 312 aa  309  5e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.67 
 
 		 303 aa  307  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  69.88 
 
 		 298 aa  305  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  58.96 
 
 		 274 aa  300  3e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.71 
 
 		 283 aa  288  8e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.37 
 
 		 291 aa  288  1e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.7 
 
 		 293 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.14 
 
 		 359 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  57.29 
 
 		 296 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.6 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  59.06 
 
 		 289 aa  280  4e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.08 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.63 
 
 		 342 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.41 
 
 		 311 aa  273  4.0000000000000004e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.08 
 
 		 270 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.11 
 
 		 295 aa  263  3e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.26 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  58.7 
 
 		 314 aa  260  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  57.26 
 
 		 275 aa  256  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.43 
 
 		 354 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  52.08 
 
 		 288 aa  249  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.92 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.25 
 
 		 301 aa  242  7.999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  53.75 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  53.75 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  53.75 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.14 
 
 		 291 aa  239  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  54.15 
 
 		 278 aa  237  2e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.76 
 
 		 275 aa  233  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.97 
 
 		 274 aa  224  2e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  40.93 
 
 		 304 aa  204  1e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.74 
 
 		 259 aa  135  8e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  35.12 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.58 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.77 
 
 		 304 aa  106  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.84 
 
 		 267 aa  105  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.63 
 
 		 248 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.63 
 
 		 248 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  31.54 
 
 		 248 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.56 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.89 
 
 		 291 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  33.47 
 
 		 291 aa  99.4  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.89 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 240 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.54 
 
 		 291 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  29.43 
 
 		 264 aa  97.4  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  32.14 
 
 		 291 aa  96.7  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  34.84 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 290 aa  96.7  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 		 247 aa  96.7  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  31.84 
 
 		 247 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  32.78 
 
 		 290 aa  95.9  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  27.89 
 
 		 258 aa  95.5  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  32.79 
 
 		 296 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.8 
 
 		 290 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  33.19 
 
 		 248 aa  94.7  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.66 
 
 		 303 aa  94.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.9 
 
 		 241 aa  95.1  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.5 
 
 		 232 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  30.53 
 
 		 262 aa  94  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.44 
 
 		 242 aa  94.4  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  31.88 
 
 		 263 aa  93.6  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.33 
 
 		 236 aa  93.2  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 		 272 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.42 
 
 		 287 aa  92.8  7e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 		 291 aa  92.8  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.31 
 
 		 256 aa  92  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.58 
 
 		 239 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  27.95 
 
 		 243 aa  91.7  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.49 
 
 		 245 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  29.73 
 
 		 283 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  31.62 
 
 		 266 aa  90.9  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  31.4 
 
 		 272 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.54 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.33 
 
 		 279 aa  89.7  6e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.5 
 
 		 285 aa  89.4  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.56 
 
 		 295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>