240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3278 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 274 aa  547  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  87.64 
 
 		 275 aa  485  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  80.22 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  80.22 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  80.22 
 
 		 275 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  79.07 
 
 		 278 aa  407  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  69.64 
 
 		 301 aa  338  4e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.76 
 
 		 295 aa  333  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  68.03 
 
 		 289 aa  318  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.04 
 
 		 311 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.98 
 
 		 312 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.25 
 
 		 359 aa  271  6e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.91 
 
 		 289 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.64 
 
 		 291 aa  268  5e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.17 
 
 		 342 aa  265  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  58.06 
 
 		 274 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 310 aa  257  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  54.05 
 
 		 309 aa  254  8e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.26 
 
 		 268 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.32 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.5 
 
 		 283 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.14 
 
 		 293 aa  245  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.92 
 
 		 338 aa  244  8e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  52.47 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  54.26 
 
 		 296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.05 
 
 		 270 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  51.42 
 
 		 314 aa  223  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.14 
 
 		 303 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  51.97 
 
 		 342 aa  223  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.19 
 
 		 354 aa  220  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.1 
 
 		 298 aa  212  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.94 
 
 		 322 aa  209  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  44 
 
 		 288 aa  209  5e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.6 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  34.98 
 
 		 304 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  32.53 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.14 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.97 
 
 		 313 aa  102  7e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  25.73 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.11 
 
 		 263 aa  100  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.09 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.78 
 
 		 304 aa  97.8  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 		 248 aa  95.9  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.54 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.69 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.66 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 247 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.75 
 
 		 236 aa  90.1  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  27.59 
 
 		 262 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 		 247 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  28.85 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.07 
 
 		 261 aa  89  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.42 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.49 
 
 		 242 aa  85.9  7e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.88 
 
 		 245 aa  85.1  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  26.34 
 
 		 264 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.28 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.39 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.09 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.74 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.22 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  28.91 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.09 
 
 		 276 aa  78.6  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  27.04 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.67 
 
 		 267 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.08 
 
 		 272 aa  75.9  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.43 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  28.33 
 
 		 249 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.69 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.86 
 
 		 241 aa  74.7  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  29.88 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  27.94 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.97 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  29.88 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  29.71 
 
 		 248 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  28.88 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.29 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.53 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  27.23 
 
 		 254 aa  73.2  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  27 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  27.94 
 
 		 272 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.69 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  22.47 
 
 		 219 aa  72  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.8 
 
 		 256 aa  72  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  24.73 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  27.53 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.57 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.11 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.88 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  26.75 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  26.97 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.73 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.39 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>