245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2975 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 275 aa  548  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  82.58 
 
 		 275 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  80.22 
 
 		 274 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  80.54 
 
 		 278 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  69.77 
 
 		 301 aa  349  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  68.38 
 
 		 289 aa  328  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.34 
 
 		 295 aa  325  6e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.84 
 
 		 311 aa  305  4.0000000000000004e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.06 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.68 
 
 		 291 aa  278  8e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.29 
 
 		 359 aa  276  2e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  56.09 
 
 		 274 aa  275  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 289 aa  272  4.0000000000000004e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.69 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.8 
 
 		 342 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.42 
 
 		 268 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  56.63 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.87 
 
 		 291 aa  259  4e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.57 
 
 		 293 aa  259  4e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.8 
 
 		 283 aa  256  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.92 
 
 		 338 aa  249  3e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 		 314 aa  241  9e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  53.23 
 
 		 275 aa  237  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.7 
 
 		 354 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.88 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  53.75 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  54.94 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.29 
 
 		 298 aa  226  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.54 
 
 		 270 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.91 
 
 		 322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  44.57 
 
 		 288 aa  208  8e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.34 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  36.61 
 
 		 304 aa  163  3e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  31.33 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.08 
 
 		 313 aa  106  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.32 
 
 		 248 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  26.32 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.11 
 
 		 263 aa  102  7e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.03 
 
 		 304 aa  92.4  8e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 247 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.98 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.23 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.4 
 
 		 251 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.63 
 
 		 240 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 247 aa  89  7e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  29.2 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.79 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.56 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.4 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.2 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  25.79 
 
 		 263 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.54 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.8 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  25.97 
 
 		 262 aa  81.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.33 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.54 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  28.52 
 
 		 266 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 		 275 aa  79.7  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  28.99 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.02 
 
 		 245 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.99 
 
 		 254 aa  78.6  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.12 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  31.17 
 
 		 274 aa  77  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  29.96 
 
 		 276 aa  77  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 		 262 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.45 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.42 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.92 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  25.3 
 
 		 264 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  29.32 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.12 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  27.66 
 
 		 254 aa  76.3  0.0000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  24.33 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.02 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  28.38 
 
 		 255 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.59 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.56 
 
 		 257 aa  75.1  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.86 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  29.03 
 
 		 272 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  26 
 
 		 275 aa  74.3  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.11 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  29.17 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.11 
 
 		 295 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.08 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.51 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.64 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  37.72 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>