250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5063 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 354 aa  684    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  79.7 
 
 		 314 aa  423  1e-117  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.86 
 
 		 359 aa  286  5e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.8 
 
 		 342 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  58.13 
 
 		 274 aa  276  5e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  52.46 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  60.25 
 
 		 289 aa  270  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.36 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.92 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.58 
 
 		 311 aa  266  5.999999999999999e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.4 
 
 		 310 aa  266  5.999999999999999e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.59 
 
 		 289 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.3 
 
 		 291 aa  264  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.79 
 
 		 303 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.58 
 
 		 283 aa  255  9e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.77 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.8 
 
 		 268 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  49.09 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.02 
 
 		 322 aa  250  2e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  55.89 
 
 		 275 aa  250  2e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.65 
 
 		 293 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.83 
 
 		 298 aa  238  8e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  53.7 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  53.7 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  53.7 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.96 
 
 		 295 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  51.71 
 
 		 278 aa  227  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  50.7 
 
 		 296 aa  225  1e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.94 
 
 		 301 aa  221  9.999999999999999e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  49.45 
 
 		 275 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.36 
 
 		 293 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.38 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.82 
 
 		 270 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  44.81 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  39.16 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  30.04 
 
 		 313 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 		 304 aa  113  4.0000000000000004e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  29.27 
 
 		 259 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 263 aa  105  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.84 
 
 		 243 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 256 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.07 
 
 		 303 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.2 
 
 		 296 aa  95.9  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  34.52 
 
 		 301 aa  95.1  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  29.2 
 
 		 248 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  29.46 
 
 		 248 aa  94  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  29.46 
 
 		 248 aa  93.2  6e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 249 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.13 
 
 		 293 aa  92.8  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.73 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.32 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  28.4 
 
 		 255 aa  90.5  4e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.61 
 
 		 240 aa  90.5  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.94 
 
 		 261 aa  90.1  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  29.84 
 
 		 243 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  29.84 
 
 		 243 aa  90.1  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  32.24 
 
 		 254 aa  89.7  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.69 
 
 		 290 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  31.69 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.8 
 
 		 267 aa  88.6  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  32.79 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.63 
 
 		 219 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  28.9 
 
 		 254 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  32.61 
 
 		 263 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.76 
 
 		 257 aa  87.8  2e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  30.2 
 
 		 247 aa  88.2  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.57 
 
 		 242 aa  87.4  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  29.2 
 
 		 247 aa  87.8  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.49 
 
 		 275 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  29.2 
 
 		 247 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 291 aa  87.4  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.4 
 
 		 236 aa  87  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.67 
 
 		 303 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 290 aa  85.9  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  31.54 
 
 		 290 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.8 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  32.79 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  28.63 
 
 		 247 aa  85.5  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.2 
 
 		 290 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.78 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  32.39 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  33.19 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.42 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 		 273 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.51 
 
 		 248 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>