213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0238 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.29 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.87 
 
 		 283 aa  192  4e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  40.93 
 
 		 342 aa  192  6e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  40.39 
 
 		 289 aa  191  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.55 
 
 		 312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  38.7 
 
 		 275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  37.64 
 
 		 274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.13 
 
 		 322 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.47 
 
 		 268 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.89 
 
 		 342 aa  179  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  37.06 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.64 
 
 		 359 aa  178  9e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.64 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.53 
 
 		 291 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.18 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.11 
 
 		 298 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.16 
 
 		 354 aa  169  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.22 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  36.23 
 
 		 278 aa  168  8e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  37.05 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.4 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.93 
 
 		 291 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  39.92 
 
 		 314 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  35.07 
 
 		 288 aa  163  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  36.61 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  36.61 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  36.61 
 
 		 275 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.99 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.82 
 
 		 293 aa  159  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.8 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.72 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.97 
 
 		 275 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.98 
 
 		 274 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.68 
 
 		 304 aa  99.4  7e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.32 
 
 		 263 aa  92.8  6e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  25.86 
 
 		 259 aa  86.7  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  27.48 
 
 		 313 aa  86.3  7e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.98 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.25 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.91 
 
 		 224 aa  78.6  0.0000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  25.48 
 
 		 248 aa  79  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.69 
 
 		 256 aa  77.8  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  25.1 
 
 		 248 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.76 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  29.48 
 
 		 254 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.52 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  26.25 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.03 
 
 		 240 aa  75.1  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.97 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.02 
 
 		 240 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.6 
 
 		 281 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  29.84 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  27.71 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  27.06 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  27.71 
 
 		 272 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  27.27 
 
 		 248 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.92 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.8 
 
 		 287 aa  70.9  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.25 
 
 		 262 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.91 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.41 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  26.91 
 
 		 272 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 		 284 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  25.09 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.42 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.42 
 
 		 285 aa  69.7  0.00000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  21.01 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  27.6 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  27.63 
 
 		 266 aa  68.9  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.81 
 
 		 241 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.29 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.78 
 
 		 273 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.91 
 
 		 245 aa  67.8  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.43 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  27.38 
 
 		 245 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  25.19 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  27.02 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  25.19 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  25.19 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  25.19 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  25.19 
 
 		 247 aa  67  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  27.02 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  27.02 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.88 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.76 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  26.14 
 
 		 255 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.58 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  27.02 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.58 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  27.24 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  26.32 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  26.61 
 
 		 263 aa  66.2  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  26.85 
 
 		 239 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  27.71 
 
 		 274 aa  65.5  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  28.06 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.94 
 
 		 261 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>