248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1452 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 314 aa  617  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  79.62 
 
 		 354 aa  412  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.71 
 
 		 359 aa  291  8e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  61.51 
 
 		 274 aa  282  4.0000000000000003e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.27 
 
 		 342 aa  280  3e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.09 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  61.09 
 
 		 289 aa  277  2e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.83 
 
 		 312 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.46 
 
 		 311 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.6 
 
 		 291 aa  270  2e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.01 
 
 		 291 aa  269  4e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  57.03 
 
 		 309 aa  269  4e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.17 
 
 		 338 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.25 
 
 		 289 aa  267  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.85 
 
 		 283 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.13 
 
 		 268 aa  256  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  58.7 
 
 		 342 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.08 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  50.54 
 
 		 275 aa  247  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.78 
 
 		 293 aa  246  3e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.19 
 
 		 322 aa  242  5e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  54.8 
 
 		 275 aa  241  9e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.15 
 
 		 298 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.31 
 
 		 295 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  51.13 
 
 		 278 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.63 
 
 		 275 aa  224  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  51.1 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.42 
 
 		 274 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.43 
 
 		 301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.63 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  43.68 
 
 		 288 aa  201  1.9999999999999998e-50  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.58 
 
 		 293 aa  199  7e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  37.89 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  30.74 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.87 
 
 		 304 aa  121  9.999999999999999e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.61 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.25 
 
 		 313 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.27 
 
 		 240 aa  98.6  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.53 
 
 		 243 aa  96.7  5e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 		 303 aa  96.3  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.8 
 
 		 257 aa  94.7  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 256 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.92 
 
 		 248 aa  92.4  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  31.44 
 
 		 263 aa  91.7  1e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.92 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.33 
 
 		 262 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.68 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.07 
 
 		 287 aa  90.5  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.81 
 
 		 236 aa  90.1  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.71 
 
 		 275 aa  89.4  8e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.64 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.94 
 
 		 267 aa  87  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  33.48 
 
 		 255 aa  87  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.71 
 
 		 251 aa  87  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.61 
 
 		 242 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  31.1 
 
 		 283 aa  86.7  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.88 
 
 		 262 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.33 
 
 		 290 aa  85.9  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  85.9  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  31.85 
 
 		 262 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  29.48 
 
 		 249 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  28.87 
 
 		 290 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.4 
 
 		 243 aa  84.7  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  28.87 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  28.62 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  27.06 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.87 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.95 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.87 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.13 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  29.74 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.23 
 
 		 290 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  31.02 
 
 		 266 aa  83.2  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 262 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.98 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.15 
 
 		 262 aa  82.4  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1303  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.07 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.06 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.32 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  26.75 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.16 
 
 		 261 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  26.75 
 
 		 243 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>