245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_25350 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 289 aa  573  1.0000000000000001e-163  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  72.03 
 
 		 311 aa  391  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.04 
 
 		 291 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.16 
 
 		 295 aa  339  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  68.38 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  68.38 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  68.38 
 
 		 275 aa  330  2e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.07 
 
 		 359 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.94 
 
 		 275 aa  323  2e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.42 
 
 		 301 aa  322  6e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  66.28 
 
 		 278 aa  318  5e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61 
 
 		 310 aa  315  4e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.26 
 
 		 342 aa  315  5e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.98 
 
 		 312 aa  313  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.81 
 
 		 274 aa  305  5.0000000000000004e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.82 
 
 		 289 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  60.8 
 
 		 274 aa  297  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.88 
 
 		 268 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.8 
 
 		 338 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.65 
 
 		 291 aa  288  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.28 
 
 		 293 aa  287  1e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  60.41 
 
 		 309 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.26 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  58.49 
 
 		 275 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  57.04 
 
 		 314 aa  279  4e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  58.53 
 
 		 342 aa  275  9e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.3 
 
 		 270 aa  270  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60 
 
 		 354 aa  270  2e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.57 
 
 		 298 aa  266  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.75 
 
 		 303 aa  265  5.999999999999999e-70  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  59.68 
 
 		 296 aa  261  6.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.35 
 
 		 322 aa  261  8.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  46.72 
 
 		 288 aa  228  1e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.95 
 
 		 293 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  39.71 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  30.86 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.87 
 
 		 263 aa  129  8.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.13 
 
 		 313 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  29.22 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.74 
 
 		 248 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.59 
 
 		 304 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  29.06 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  30.68 
 
 		 247 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.1 
 
 		 251 aa  102  9e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.92 
 
 		 248 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 261 aa  99.8  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  99  9e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 247 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.56 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.83 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.8 
 
 		 267 aa  96.3  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.31 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.81 
 
 		 240 aa  95.1  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.14 
 
 		 303 aa  93.2  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.21 
 
 		 243 aa  93.2  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 290 aa  92.8  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.06 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  33.88 
 
 		 272 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  32.06 
 
 		 254 aa  91.3  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  30.52 
 
 		 296 aa  90.5  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.87 
 
 		 281 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.09 
 
 		 236 aa  89.7  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  33.47 
 
 		 272 aa  89.4  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.47 
 
 		 295 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  33.88 
 
 		 272 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.47 
 
 		 284 aa  89  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  27.66 
 
 		 263 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.97 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  28.16 
 
 		 264 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.71 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  29.27 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 		 290 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.19 
 
 		 256 aa  88.2  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 		 291 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  31.23 
 
 		 301 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  29.27 
 
 		 291 aa  87.4  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  29.96 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.95 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.34 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.15 
 
 		 232 aa  86.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.27 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.27 
 
 		 290 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.43 
 
 		 248 aa  86.3  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.93 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  32.31 
 
 		 266 aa  86.3  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.93 
 
 		 290 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.12 
 
 		 303 aa  85.5  9e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>