251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1204 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 274 aa  549  1e-155  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  77.39 
 
 		 291 aa  402  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  70.94 
 
 		 312 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.21 
 
 		 289 aa  352  5e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  64.78 
 
 		 283 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.9 
 
 		 338 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.69 
 
 		 311 aa  300  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  60.8 
 
 		 289 aa  297  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  62.15 
 
 		 309 aa  291  5e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.96 
 
 		 359 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  58.96 
 
 		 342 aa  289  3e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.89 
 
 		 268 aa  286  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.86 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  61.51 
 
 		 314 aa  282  3.0000000000000004e-75  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.61 
 
 		 342 aa  278  5e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.54 
 
 		 293 aa  277  1e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  56.09 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  56.09 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  56.09 
 
 		 275 aa  275  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.13 
 
 		 354 aa  275  6e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.92 
 
 		 295 aa  274  9e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.63 
 
 		 275 aa  265  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.77 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.13 
 
 		 303 aa  263  3e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.72 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.38 
 
 		 301 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.33 
 
 		 310 aa  255  4e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  55.88 
 
 		 275 aa  254  9e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  56.56 
 
 		 278 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.06 
 
 		 274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.04 
 
 		 270 aa  228  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  47.33 
 
 		 288 aa  227  2e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  53.66 
 
 		 296 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.61 
 
 		 293 aa  208  8e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  37.64 
 
 		 304 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  34.41 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.68 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.86 
 
 		 263 aa  129  7.000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  34.68 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.22 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  27.8 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  28.3 
 
 		 262 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.64 
 
 		 243 aa  104  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.3 
 
 		 267 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.82 
 
 		 245 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.61 
 
 		 242 aa  101  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.97 
 
 		 236 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.94 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.38 
 
 		 240 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.89 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  29.58 
 
 		 247 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  29.88 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  28.95 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.88 
 
 		 261 aa  95.1  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.29 
 
 		 248 aa  95.1  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  29.88 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.44 
 
 		 241 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.92 
 
 		 259 aa  94.4  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  94  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.92 
 
 		 303 aa  93.6  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  28.57 
 
 		 263 aa  93.2  4e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.99 
 
 		 247 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 287 aa  91.3  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.92 
 
 		 248 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  28.51 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30 
 
 		 254 aa  89.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  31.06 
 
 		 248 aa  89.4  6e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 		 242 aa  89.4  6e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.63 
 
 		 251 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  27.69 
 
 		 264 aa  87.8  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  24.48 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.25 
 
 		 285 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.64 
 
 		 285 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  27.23 
 
 		 247 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.19 
 
 		 254 aa  87.4  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  28.85 
 
 		 254 aa  86.7  4e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.62 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  26.64 
 
 		 249 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.78 
 
 		 224 aa  82.8  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 		 272 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.25 
 
 		 275 aa  82.8  0.000000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  28.34 
 
 		 291 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.42 
 
 		 285 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.29 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  31.25 
 
 		 266 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  28.97 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 		 271 aa  79.7  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  28.16 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>