232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2373 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 295 aa  582  1.0000000000000001e-165  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.44 
 
 		 301 aa  340  2e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.84 
 
 		 275 aa  335  7.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  68.7 
 
 		 289 aa  330  2e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  64.34 
 
 		 275 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  64.34 
 
 		 275 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  64.34 
 
 		 275 aa  325  7e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.27 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.81 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  63.04 
 
 		 278 aa  311  9e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.89 
 
 		 312 aa  291  9e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.18 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.9 
 
 		 310 aa  279  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.25 
 
 		 291 aa  278  7e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  58.11 
 
 		 309 aa  277  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.21 
 
 		 342 aa  276  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.2 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.62 
 
 		 291 aa  275  7e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  56.92 
 
 		 274 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.9 
 
 		 293 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.9 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.11 
 
 		 268 aa  266  2e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.3 
 
 		 270 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  56.11 
 
 		 342 aa  255  5e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  54.79 
 
 		 296 aa  255  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.6 
 
 		 303 aa  254  9e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.25 
 
 		 283 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.98 
 
 		 322 aa  237  2e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  52.12 
 
 		 275 aa  237  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  56.85 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  47.79 
 
 		 288 aa  235  8e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.84 
 
 		 354 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.93 
 
 		 298 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.67 
 
 		 293 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  36.4 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  31.66 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.53 
 
 		 263 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.54 
 
 		 313 aa  108  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.45 
 
 		 248 aa  105  9e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  26.45 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.78 
 
 		 267 aa  99.4  7e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.48 
 
 		 304 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  29.48 
 
 		 247 aa  96.3  5e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.27 
 
 		 251 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  29.88 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.5 
 
 		 243 aa  92.4  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  29.8 
 
 		 247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.44 
 
 		 245 aa  90.5  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.89 
 
 		 303 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  28.22 
 
 		 248 aa  89  8e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.43 
 
 		 240 aa  88.6  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.97 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.98 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  27.12 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.71 
 
 		 261 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.44 
 
 		 241 aa  86.7  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.69 
 
 		 243 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  27.94 
 
 		 247 aa  85.9  7e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  27.76 
 
 		 254 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  26.52 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.62 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.51 
 
 		 248 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  29 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  26.94 
 
 		 258 aa  84  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.98 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.03 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.49 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.36 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.49 
 
 		 290 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.83 
 
 		 242 aa  81.6  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  28.46 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  30.08 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  29.96 
 
 		 291 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  26.85 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.55 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.55 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  29.55 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  30.28 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 		 281 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 		 262 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.69 
 
 		 273 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  29.67 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  26.69 
 
 		 320 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.27 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.53 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>