249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1491 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
289 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  72.28 
 
 
312 aa  409  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  78.95 
 
 
283 aa  382  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  64.21 
 
 
274 aa  352  5.9999999999999994e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.89 
 
 
291 aa  325  7e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  57.14 
 
 
309 aa  304  1.0000000000000001e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  61.34 
 
 
342 aa  302  5.000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  61.07 
 
 
289 aa  301  6.000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60 
 
 
359 aa  301  7.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.39 
 
 
310 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.53 
 
 
338 aa  298  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.48 
 
 
342 aa  296  3e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.3 
 
 
303 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  62.6 
 
 
322 aa  292  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.83 
 
 
311 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  59.23 
 
 
275 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.65 
 
 
298 aa  274  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.11 
 
 
301 aa  273  3e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  57.2 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  57.2 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  57.2 
 
 
275 aa  272  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.9 
 
 
295 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.37 
 
 
275 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.32 
 
 
268 aa  268  5e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  56 
 
 
278 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  60.25 
 
 
314 aa  267  1e-70  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.14 
 
 
293 aa  267  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.59 
 
 
354 aa  264  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.91 
 
 
274 aa  258  6e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  55.98 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  58.54 
 
 
270 aa  250  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.39 
 
 
291 aa  249  5e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  46.9 
 
 
288 aa  228  8e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  40.29 
 
 
304 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.76 
 
 
293 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  35.39 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.25 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  35.42 
 
 
313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.96 
 
 
304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  30.04 
 
 
262 aa  109  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.05 
 
 
243 aa  106  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.1 
 
 
238 aa  102  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  32.38 
 
 
254 aa  102  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  29.17 
 
 
248 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  29.17 
 
 
248 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.93 
 
 
240 aa  98.2  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  32.17 
 
 
266 aa  96.3  5e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  28.08 
 
 
243 aa  96.3  6e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.16 
 
 
241 aa  95.1  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  30.19 
 
 
254 aa  93.6  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  31.6 
 
 
248 aa  93.2  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.93 
 
 
256 aa  92.8  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.28 
 
 
267 aa  92.8  7e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.69 
 
 
245 aa  92.4  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  31.58 
 
 
274 aa  91.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.16 
 
 
242 aa  92  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  32.41 
 
 
275 aa  90.9  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  27.91 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  27.91 
 
 
247 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  29.67 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  30.16 
 
 
296 aa  90.9  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.19 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.19 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  28.19 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  28.74 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.65 
 
 
251 aa  90.1  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.19 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.19 
 
 
247 aa  89.7  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  29.92 
 
 
249 aa  89.4  6e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.43 
 
 
262 aa  89  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.84 
 
 
259 aa  89  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.13 
 
 
262 aa  89  9e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  31.02 
 
 
291 aa  89  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.69 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  27.13 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.58 
 
 
291 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.84 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  30.59 
 
 
301 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.69 
 
 
284 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  29.92 
 
 
239 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.67 
 
 
290 aa  88.6  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.27 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  32.93 
 
 
262 aa  87.4  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  30.61 
 
 
291 aa  87  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  30.17 
 
 
291 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.6 
 
 
236 aa  87.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  31.6 
 
 
247 aa  87  3e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.87 
 
 
285 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  31.79 
 
 
304 aa  87  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.61 
 
 
290 aa  86.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  28.35 
 
 
243 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  28.35 
 
 
243 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>