258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0111 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 245 aa  497  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  71.01 
 
 		 242 aa  357  9.999999999999999e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  65.97 
 
 		 241 aa  337  9.999999999999999e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  66.81 
 
 		 239 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  63.49 
 
 		 255 aa  328  4e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  54.98 
 
 		 248 aa  265  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  36.63 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.4 
 
 		 248 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.66 
 
 		 285 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.17 
 
 		 285 aa  151  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  37.14 
 
 		 262 aa  150  2e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  35.46 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  37.39 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  36.44 
 
 		 266 aa  140  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.49 
 
 		 273 aa  138  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  34.66 
 
 		 247 aa  138  7e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0384  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.17 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.268591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.66 
 
 		 287 aa  137  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  36.52 
 
 		 271 aa  135  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  34.3 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  34.3 
 
 		 247 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.04 
 
 		 285 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.59 
 
 		 301 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.17 
 
 		 272 aa  131  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  33.61 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  34.41 
 
 		 283 aa  128  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 		 248 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.53 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  35 
 
 		 275 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  34.45 
 
 		 276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  36 
 
 		 263 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.52 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35.14 
 
 		 279 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37 
 
 		 269 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  35.48 
 
 		 291 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 283 aa  124  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  32.65 
 
 		 249 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  31.82 
 
 		 272 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.32 
 
 		 338 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 		 276 aa  123  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  33.6 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  34.55 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.6 
 
 		 302 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.5 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.64 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.11 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  34.6 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  35.02 
 
 		 290 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 		 290 aa  122  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  34.7 
 
 		 293 aa  122  7e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.56 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  122  7e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  32.52 
 
 		 293 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 284 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.25 
 
 		 303 aa  121  9e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.32 
 
 		 273 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.39 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 		 272 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  35.02 
 
 		 291 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 290 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.89 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.35 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3861  condensin subunit ScpA  34.96 
 
 		 282 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 290 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.6 
 
 		 275 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  32.48 
 
 		 286 aa  120  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 		 236 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.21 
 
 		 281 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 		 276 aa  119  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 267 aa  118  7e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.48 
 
 		 286 aa  118  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  33.33 
 
 		 243 aa  117  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  34.82 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.77 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.2 
 
 		 297 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32 
 
 		 287 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  32.6 
 
 		 275 aa  115  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.48 
 
 		 275 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.51 
 
 		 285 aa  115  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>