261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1926 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 285 aa  570  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  94.74 
 
 		 285 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  66.15 
 
 		 273 aa  335  7e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  59 
 
 		 245 aa  262  4e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  60.08 
 
 		 266 aa  262  6e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.88 
 
 		 272 aa  261  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54 
 
 		 273 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  51.28 
 
 		 254 aa  222  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.96 
 
 		 248 aa  203  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  46.56 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.83 
 
 		 275 aa  191  9e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  47.11 
 
 		 276 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.08 
 
 		 269 aa  186  4e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.44 
 
 		 276 aa  182  5.0000000000000004e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.44 
 
 		 285 aa  181  8.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  43.75 
 
 		 279 aa  180  2e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2120  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.66 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.781552  normal  0.053022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  43.37 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.37 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2261  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.315795  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2172  chromosome segregation and condensation protein ScpA  47.11 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.991171  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  44.07 
 
 		 275 aa  177  3e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.16 
 
 		 275 aa  176  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  44.02 
 
 		 266 aa  176  5e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.14 
 
 		 282 aa  176  5e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.2 
 
 		 303 aa  176  5e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.19 
 
 		 283 aa  175  7e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  43.46 
 
 		 271 aa  175  8e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.74 
 
 		 285 aa  175  9e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.46 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.8 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.62 
 
 		 287 aa  174  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.46 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1684  condensin subunit ScpA  46.67 
 
 		 301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.154511  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.46 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  42.06 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  43.8 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  42.97 
 
 		 304 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.8 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  42.86 
 
 		 247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  42.06 
 
 		 262 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.06 
 
 		 262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  42.06 
 
 		 262 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.76 
 
 		 278 aa  172  7.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.46 
 
 		 262 aa  171  1e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  43.09 
 
 		 272 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.56 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  42.06 
 
 		 262 aa  171  2e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  43.09 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  42.15 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  42.74 
 
 		 248 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  42.15 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  41.49 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  42.21 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  43.44 
 
 		 272 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  42.21 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  41.49 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  42.15 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  42.15 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  42.15 
 
 		 247 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  43.7 
 
 		 266 aa  169  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.29 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.68 
 
 		 285 aa  168  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  41.53 
 
 		 301 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  42.45 
 
 		 263 aa  167  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  42.15 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.88 
 
 		 261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  41.13 
 
 		 296 aa  165  8e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  41.9 
 
 		 254 aa  165  9e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  42.56 
 
 		 283 aa  165  9e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.39 
 
 		 284 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  40 
 
 		 293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.39 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  43.19 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  40.89 
 
 		 293 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.53 
 
 		 262 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.62 
 
 		 276 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  45.64 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.39 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  43.15 
 
 		 274 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.06 
 
 		 287 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  41.56 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.94 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.49 
 
 		 287 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.68 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  44.4 
 
 		 250 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.68 
 
 		 293 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.49 
 
 		 262 aa  159  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.08 
 
 		 291 aa  158  8e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.34 
 
 		 262 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  41.13 
 
 		 262 aa  158  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.51 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.49 
 
 		 262 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  38.08 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  42.02 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  39.92 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.68 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  38.87 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  38.87 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  38.87 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>