253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1160 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
275 aa  546  1e-154  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  64.36 
 
 
320 aa  342  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.02 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  63.02 
 
 
302 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.93 
 
 
301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.61 
 
 
269 aa  322  3e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  63.53 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  64.2 
 
 
275 aa  318  6e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  61.96 
 
 
296 aa  316  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  61.45 
 
 
272 aa  313  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  60.4 
 
 
266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.11 
 
 
281 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  60.8 
 
 
275 aa  311  5.999999999999999e-84  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  60.3 
 
 
272 aa  311  6.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  60.3 
 
 
272 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.6 
 
 
281 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  60.9 
 
 
284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.15 
 
 
284 aa  305  6e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  61.39 
 
 
295 aa  304  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  58.11 
 
 
276 aa  302  5.000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1838  condensin subunit ScpA  60.44 
 
 
274 aa  299  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0491954  normal  0.871513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.14 
 
 
275 aa  298  6e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  58.97 
 
 
304 aa  297  1e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  58.2 
 
 
271 aa  289  4e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  64.78 
 
 
250 aa  284  9e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.13 
 
 
285 aa  281  9e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3015  hypothetical protein  54.62 
 
 
262 aa  279  4e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1531  condensin subunit ScpA  54.62 
 
 
262 aa  278  9e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.265765  normal  0.0177509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.54 
 
 
287 aa  276  2e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1465  condensin subunit ScpA  54.62 
 
 
262 aa  277  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1523  condensin subunit ScpA  54.62 
 
 
262 aa  276  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0108489 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2400  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.49 
 
 
262 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.463667  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.23 
 
 
262 aa  273  3e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.04 
 
 
262 aa  271  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.28 
 
 
285 aa  270  2e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2719  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.46 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2698  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 
262 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.71 
 
 
262 aa  269  4e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2798  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 
262 aa  268  5e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.516389  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1667  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 
262 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00264428  hitchhiker  0.000433326 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.52 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2126  putative segregation and condensation protein A  54.69 
 
 
262 aa  265  5.999999999999999e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.55 
 
 
297 aa  265  8.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.64 
 
 
286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  55.64 
 
 
286 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.76 
 
 
262 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0957  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.33 
 
 
283 aa  252  6e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.09 
 
 
276 aa  249  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.92 
 
 
278 aa  248  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1400  hypothetical protein  50 
 
 
263 aa  247  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1596  hypothetical protein  50.4 
 
 
263 aa  247  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  52.73 
 
 
283 aa  246  2e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.52 
 
 
282 aa  246  4e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.61 
 
 
293 aa  245  6e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.76 
 
 
276 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  51.95 
 
 
293 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.27 
 
 
303 aa  242  5e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.71 
 
 
290 aa  242  5e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  54.66 
 
 
283 aa  242  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2195  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.24 
 
 
293 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.156769 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  50.72 
 
 
291 aa  241  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  50.78 
 
 
291 aa  241  9e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.95 
 
 
290 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.95 
 
 
290 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  51.87 
 
 
293 aa  240  2e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.16 
 
 
291 aa  239  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  50.36 
 
 
291 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.33 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.33 
 
 
290 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.78 
 
 
287 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1211  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.39 
 
 
291 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000668122  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  52.11 
 
 
296 aa  238  8e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.95 
 
 
290 aa  238  8e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  50.57 
 
 
290 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.97 
 
 
290 aa  238  1e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.64 
 
 
303 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  52.53 
 
 
301 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  50.97 
 
 
283 aa  233  3e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  50.99 
 
 
274 aa  228  7e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.43 
 
 
266 aa  228  9e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.319495  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  50.2 
 
 
266 aa  223  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.16 
 
 
285 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.16 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.32 
 
 
315 aa  169  5e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  42.74 
 
 
273 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1569  condensin subunit ScpA  37.86 
 
 
288 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.729802  normal  0.82385 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1751  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.08 
 
 
288 aa  163  3e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.133467  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  42.61 
 
 
254 aa  159  6e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1790  segregation and condensation protein A  38.08 
 
 
273 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1467  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.08 
 
 
273 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  39.92 
 
 
263 aa  154  1e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  40.89 
 
 
245 aa  152  5e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.63 
 
 
287 aa  143  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>