244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1238 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 275 aa  543  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.22 
 
 		 312 aa  305  6e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.23 
 
 		 289 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  60.64 
 
 		 289 aa  294  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.92 
 
 		 311 aa  286  4e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60 
 
 		 283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.58 
 
 		 338 aa  276  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.96 
 
 		 310 aa  271  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.64 
 
 		 322 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  57.09 
 
 		 309 aa  266  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.54 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.72 
 
 		 291 aa  261  1e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  55.88 
 
 		 274 aa  257  1e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.51 
 
 		 303 aa  257  2e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.11 
 
 		 268 aa  256  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59 
 
 		 354 aa  256  4e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.27 
 
 		 342 aa  254  8e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  57.26 
 
 		 342 aa  252  5.000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.36 
 
 		 291 aa  249  4e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.81 
 
 		 293 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  50.18 
 
 		 301 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  54.98 
 
 		 278 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.69 
 
 		 295 aa  245  6e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  52.38 
 
 		 314 aa  245  6.999999999999999e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  52.38 
 
 		 296 aa  244  9.999999999999999e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  53.39 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  53.39 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  53.39 
 
 		 275 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.56 
 
 		 270 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.45 
 
 		 298 aa  236  2e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  51.97 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.08 
 
 		 274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  46.43 
 
 		 288 aa  219  3e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  40.61 
 
 		 304 aa  193  3e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.31 
 
 		 293 aa  184  9e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.06 
 
 		 259 aa  132  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 263 aa  128  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.8 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.74 
 
 		 304 aa  116  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.47 
 
 		 243 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.35 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.33 
 
 		 242 aa  99  8e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  26.21 
 
 		 248 aa  97.8  2e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  26.34 
 
 		 248 aa  97.1  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.67 
 
 		 240 aa  95.5  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.43 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  32.08 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 247 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  32.92 
 
 		 247 aa  93.2  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  32.5 
 
 		 247 aa  92.8  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.13 
 
 		 245 aa  92.8  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  33.19 
 
 		 247 aa  92.8  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 254 aa  92.4  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.29 
 
 		 248 aa  92.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  32.2 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  32.2 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.39 
 
 		 251 aa  92  9e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  26.8 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.8 
 
 		 261 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.2 
 
 		 257 aa  88.6  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.17 
 
 		 239 aa  85.5  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  29.96 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  28.12 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  29.64 
 
 		 254 aa  83.2  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  33.19 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.27 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  27.89 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  27.89 
 
 		 243 aa  80.1  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  29.28 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  26.98 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.57 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.41 
 
 		 273 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 256 aa  79.3  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  24.7 
 
 		 235 aa  79  0.00000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.11 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  28.81 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  30.36 
 
 		 255 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  26.83 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  26.61 
 
 		 247 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  29.13 
 
 		 276 aa  77.4  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.25 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.83 
 
 		 262 aa  77  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.15 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.77 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  29.69 
 
 		 275 aa  75.9  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1432  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.11 
 
 		 262 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0342  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.33 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101989  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.87 
 
 		 290 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0645  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.28 
 
 		 287 aa  75.5  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.01 
 
 		 262 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.77 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  42.11 
 
 		 266 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  30.08 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.69 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.83 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>