250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4345 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 		 254 aa  499  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0194  chromosome segregation and condensation protein ScpA  75.11 
 
 		 250 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0801589  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0342  chromosome segregation and condensation protein ScpA  46.38 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101989  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3493  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.42 
 
 		 257 aa  182  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  33.9 
 
 		 263 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.07 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.69 
 
 		 248 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  30.17 
 
 		 243 aa  106  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.78 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  31.44 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.13 
 
 		 236 aa  102  4e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  28.34 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.72 
 
 		 243 aa  101  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  32.24 
 
 		 313 aa  100  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.08 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 285 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  34.51 
 
 		 275 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.58 
 
 		 263 aa  99.8  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  31.05 
 
 		 247 aa  99.4  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.91 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  29.44 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  30.31 
 
 		 254 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  98.6  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 247 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  31.17 
 
 		 266 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  29.75 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  97.8  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  31.2 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  29.49 
 
 		 242 aa  98.6  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 247 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.93 
 
 		 275 aa  96.7  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 		 338 aa  95.9  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.11 
 
 		 303 aa  95.1  8e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  31.38 
 
 		 275 aa  95.1  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  32.08 
 
 		 272 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1683  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.17 
 
 		 257 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.875947  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  32.62 
 
 		 245 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.99 
 
 		 287 aa  94  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  31.38 
 
 		 266 aa  94.4  2e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1725  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.47 
 
 		 285 aa  93.6  3e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.932075 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.59 
 
 		 311 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.86 
 
 		 273 aa  93.2  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  31.67 
 
 		 272 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  31.45 
 
 		 304 aa  92.8  4e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.38 
 
 		 281 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  27.8 
 
 		 247 aa  92.4  6e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.38 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.38 
 
 		 284 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  25.2 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  23.68 
 
 		 224 aa  91.7  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.54 
 
 		 281 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  31.78 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.81 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.33 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.25 
 
 		 304 aa  90.9  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.19 
 
 		 238 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.42 
 
 		 272 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.69 
 
 		 262 aa  90.1  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  33.06 
 
 		 275 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  30.38 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0307  segregation and condensation protein A  30.17 
 
 		 237 aa  89.7  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  31.98 
 
 		 279 aa  89.7  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  31.67 
 
 		 296 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.67 
 
 		 315 aa  89  6e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  30.42 
 
 		 249 aa  89  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  28.26 
 
 		 254 aa  89  7e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.97 
 
 		 275 aa  89  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  32.03 
 
 		 239 aa  88.6  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  30.52 
 
 		 255 aa  88.6  9e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  28.81 
 
 		 264 aa  88.6  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.31 
 
 		 267 aa  88.2  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.74 
 
 		 291 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  33.19 
 
 		 274 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 		 269 aa  87.8  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.97 
 
 		 295 aa  87  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.62 
 
 		 261 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  31.02 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 		 248 aa  87.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.85 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.54 
 
 		 301 aa  87.4  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.08 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  30.08 
 
 		 302 aa  86.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.02 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.14 
 
 		 272 aa  86.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.19 
 
 		 242 aa  86.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.18 
 
 		 312 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15660  chromosome segregation and condensation protein A  31.38 
 
 		 284 aa  85.1  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.220063  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.64 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  32.03 
 
 		 250 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 256 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  31.2 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2447  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.42 
 
 		 262 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>