252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3493 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3493  chromosome segregation and condensation protein ScpA  100 
 
 
257 aa  501  1e-141  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  45.42 
 
 
254 aa  196  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0342  chromosome segregation and condensation protein ScpA  48.74 
 
 
248 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101989  hitchhiker  0.00131958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0194  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.15 
 
 
250 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0801589  hitchhiker  0.00689338 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.67 
 
 
267 aa  107  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.22 
 
 
285 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.78 
 
 
285 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.52 
 
 
248 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  30.99 
 
 
243 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  30.99 
 
 
243 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.91 
 
 
248 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0821  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.67 
 
 
240 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  33.71 
 
 
254 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  29.67 
 
 
243 aa  101  9e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  34.14 
 
 
254 aa  101  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  31.35 
 
 
248 aa  99  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.59 
 
 
261 aa  99  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  30.16 
 
 
263 aa  98.6  8e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0849  condensin subunit ScpA  38.22 
 
 
304 aa  98.6  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.91997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.38 
 
 
236 aa  98.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  30.43 
 
 
247 aa  98.6  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.04 
 
 
272 aa  97.4  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.5 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.63 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.63 
 
 
247 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.14 
 
 
248 aa  97.1  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.7  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  30.52 
 
 
247 aa  96.3  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.22 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.63 
 
 
251 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.4 
 
 
243 aa  95.5  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.75 
 
 
238 aa  93.2  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.04 
 
 
273 aa  92.8  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  33.49 
 
 
245 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  28.27 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.58 
 
 
248 aa  92  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.94 
 
 
240 aa  90.9  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1720  condensin subunit ScpA  32.05 
 
 
320 aa  90.1  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1256  condensin subunit ScpA  34.73 
 
 
274 aa  89.4  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  33.93 
 
 
276 aa  89  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  32.75 
 
 
283 aa  89  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  29.39 
 
 
258 aa  87.8  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  33.33 
 
 
249 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  28.63 
 
 
259 aa  87.8  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1928  hypothetical protein  33.33 
 
 
296 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.247592  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  31.84 
 
 
254 aa  88.2  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  31.64 
 
 
313 aa  88.2  1e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.98 
 
 
263 aa  87.8  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.92 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3030  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.49 
 
 
282 aa  87.4  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.31706  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.51 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.05 
 
 
259 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  33.19 
 
 
271 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.2 
 
 
304 aa  85.9  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.74 
 
 
275 aa  85.5  7e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1595  segregation and condensation protein A  27.73 
 
 
235 aa  85.5  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 
311 aa  85.1  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22840  hypothetical protein  32.05 
 
 
250 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.232942 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  32.44 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  27.6 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.94 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.94 
 
 
290 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4091  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.04 
 
 
278 aa  84.3  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  32.16 
 
 
279 aa  84.3  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.08 
 
 
275 aa  84  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  30.52 
 
 
272 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2826  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.74 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.94 
 
 
290 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.05 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.02 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.94 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.94 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.02 
 
 
303 aa  82.4  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02285  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.93 
 
 
287 aa  82.4  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151307  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0906  condensin subunit ScpA  30.18 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.58 
 
 
285 aa  82.4  0.000000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.39 
 
 
338 aa  82.4  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  31.58 
 
 
291 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.83 
 
 
281 aa  82  0.000000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.49 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  30.74 
 
 
274 aa  82  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.75 
 
 
359 aa  82  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1954  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.28 
 
 
315 aa  82  0.000000000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.7 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2248  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.36 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00439648 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.76 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.15 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  30.49 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>