240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11724 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_11724  hypothetical protein  100 
 
 
278 aa  555  1e-157  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.295485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2931  condensin subunit ScpA  80.54 
 
 
275 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2975  condensin subunit ScpA  80.54 
 
 
275 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455649  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2946  condensin subunit ScpA  80.54 
 
 
275 aa  403  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0970123  normal  0.229221 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3497  chromosome segregation and condensation protein ScpA  76.86 
 
 
275 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.219886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3278  chromosome segregation and condensation protein ScpA  79.07 
 
 
274 aa  389  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2819  chromosome segregation and condensation protein ScpA  68.65 
 
 
301 aa  338  7e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.119022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25350  condensin subunit ScpA  66.93 
 
 
289 aa  317  1e-85  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493561 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2373  chromosome segregation and condensation protein ScpA  63.04 
 
 
295 aa  311  9e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.140634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  60.51 
 
 
311 aa  310  2e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.678598  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2832  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.44 
 
 
312 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0391082  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4056  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.24 
 
 
291 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.735378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  57.48 
 
 
359 aa  269  4e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1491  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56 
 
 
289 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.400172  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2495  condensin subunit ScpA  54.58 
 
 
309 aa  261  6.999999999999999e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0974  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.36 
 
 
291 aa  254  9e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.369715  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1204  condensin subunit ScpA  56.56 
 
 
274 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1917  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.73 
 
 
342 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.536791  hitchhiker  0.00457566 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2994  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.16 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2991  chromosome segregation and condensation protein ScpA  59.52 
 
 
268 aa  250  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.500216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4427  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.41 
 
 
310 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0991582  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3122  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.98 
 
 
293 aa  248  8e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.129768  hitchhiker  0.00203337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2455  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.92 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.579083  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1238  condensin subunit ScpA  54.44 
 
 
275 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.795284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1532  condensin subunit ScpA  54.24 
 
 
296 aa  236  4e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0065622  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1452  condensin subunit ScpA  51.13 
 
 
314 aa  232  6e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00707471 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19900  condensin subunit ScpA  54.15 
 
 
342 aa  228  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5063  chromosome segregation and condensation protein ScpA  54.1 
 
 
354 aa  224  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0369754  normal  0.0383606 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2155  chromosome segregation and condensation protein ScpA  55.1 
 
 
303 aa  223  3e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206898  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1532  chromosome segregation and condensation protein ScpA  53.1 
 
 
270 aa  219  3e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000075545 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1930  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.24 
 
 
322 aa  216  4e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.441348  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1562  chromosome segregation and condensation protein ScpA  52.9 
 
 
298 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15210  hypothetical protein  44.4 
 
 
288 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0264564  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1268  chromosome segregation and condensation protein ScpA  43.57 
 
 
293 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0238  hypothetical protein  36.23 
 
 
304 aa  168  7e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09620  hypothetical protein  33.33 
 
 
259 aa  120  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0183259  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  28.86 
 
 
248 aa  105  8e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06800  hypothetical protein  30.71 
 
 
313 aa  105  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.147317  normal  0.465292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1327  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.66 
 
 
263 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.583538  normal  0.373498 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
248 aa  102  5e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3644  condensin subunit ScpA  27.95 
 
 
262 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.4 
 
 
251 aa  97.1  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0721  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.64 
 
 
304 aa  95.5  8e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00886352  normal  0.0253766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.72 
 
 
261 aa  92.8  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  28.57 
 
 
247 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.03 
 
 
245 aa  90.9  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  28.34 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07170  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.81 
 
 
243 aa  89.4  5e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000172776  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.81 
 
 
240 aa  89.4  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0132  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.38 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.787222  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.97 
 
 
287 aa  86.7  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  87  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  87  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  87  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  28.46 
 
 
247 aa  86.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1160  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.54 
 
 
275 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  27.73 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.49 
 
 
243 aa  85.9  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.76 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  31.03 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4345  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.2 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.331059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  26.77 
 
 
248 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2190  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.81 
 
 
232 aa  83.2  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000282067  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.8 
 
 
238 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  27.35 
 
 
263 aa  82.8  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0093  putative segregation and condensation protein A  30.13 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.69 
 
 
236 aa  82  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.58 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 
281 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  28.81 
 
 
242 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  27.24 
 
 
273 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  29.55 
 
 
254 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  30.13 
 
 
248 aa  79.7  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  27.04 
 
 
266 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  26.92 
 
 
254 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.07 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376675  decreased coverage  0.00403881 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.79 
 
 
272 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0097  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.7 
 
 
241 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0377485  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  28.85 
 
 
296 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.57 
 
 
284 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.96 
 
 
281 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.92 
 
 
285 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1464  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.7 
 
 
224 aa  77  0.0000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30.07 
 
 
262 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  29.18 
 
 
295 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  28.85 
 
 
301 aa  75.5  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  31.54 
 
 
293 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  28.8 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  26.07 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2762  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.13 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.151501 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  30 
 
 
290 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  29.6 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>