262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0687 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0687  condensin subunit ScpA  100 
 
 		 264 aa  527  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1747  chromosome segregation and condensation protein ScpA  56.23 
 
 		 267 aa  295  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.789122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1566  chromosome segregation and condensation protein ScpA  44.81 
 
 		 243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0721026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1134  chromosome segregation and condensation protein ScpA  41.46 
 
 		 251 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2297  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.54 
 
 		 285 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1058  segregation and condensation protein A  41.49 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1774  segregation and condensation protein A  40.56 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2060  segregation and condensation protein A  41.74 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.721203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1926  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.6 
 
 		 285 aa  156  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2233  segregation and condensation protein A  40.4 
 
 		 254 aa  155  6e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.292577  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1832  hypothetical protein  38.03 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.85577  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3847  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.43 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1583  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1552  hypothetical protein  40.25 
 
 		 243 aa  152  5e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2249  chromosome segregation and condensation protein ScpA  40.23 
 
 		 273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2584  chromosome segregation and condensation protein ScpA  39.43 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000515385  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0755  condensin subunit ScpA  37.7 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000908175  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3887  segregation and condensation protein A  39.36 
 
 		 247 aa  148  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0391  segregation and condensation protein A  41.06 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2757  segregation and condensation protein A  37.15 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4125  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1071  segregation and condensation protein A  37.96 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4167  segregation and condensation protein A  37.96 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0529217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4078  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000932909 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3799  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3814  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4189  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0914605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3968  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4278  segregation and condensation protein A  38.27 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0873  hypothetical protein  38.33 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0366031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0793  chromosome segregation and condensation protein ScpA  38.66 
 
 		 236 aa  141  9e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.148291  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0721  condensin subunit ScpA  37.86 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5641  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.06 
 
 		 285 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.720807 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3425  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.62 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1223  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.44 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0979835  normal  0.2931 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1299  hypothetical protein  38.6 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1959  condensin subunit ScpA  39.42 
 
 		 266 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000817707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3584  hypothetical protein  36.03 
 
 		 272 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.169624 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2689  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.71 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1874  condensin subunit ScpA  33.46 
 
 		 266 aa  133  3e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1812  hypothetical protein  36.03 
 
 		 272 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00873  segregation and condensation protein A  35.29 
 
 		 279 aa  133  3.9999999999999996e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.447056  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0703  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.100396  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1205  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.65899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1623  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000113336  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1051  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2976  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0309042  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1044  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2310  segregation and condensation protein A  33.88 
 
 		 291 aa  132  5e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1489  condensin subunit ScpA  37.66 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.310818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2196  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.88 
 
 		 290 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444422  normal  0.714691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1883  chromosome segregation and condensation protein ScpA  37.3 
 
 		 273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0105417  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3787  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.2 
 
 		 281 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000132803 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2013  hypothetical protein  34.69 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0206246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2457  condensin subunit ScpA  35.29 
 
 		 283 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.27105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0669  condensin subunit ScpA  33.33 
 
 		 296 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0849  segregation and condensation protein A  33.06 
 
 		 291 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.692099  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1554  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.19 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.159345  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1610  segregation and condensation protein A  35.19 
 
 		 302 aa  129  6e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.769993  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2318  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.76 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1688  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.98 
 
 		 272 aa  128  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.176972  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4004  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.44 
 
 		 281 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000471575 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5772  condensin subunit ScpA  33.06 
 
 		 290 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160847  normal  0.239961 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0583  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.56 
 
 		 275 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.373152  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1317  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.66 
 
 		 248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.472506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3492  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 		 286 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.367211  normal  0.705468 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0853  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1830  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.592453  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2441  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2668  condensin subunit ScpA  33.06 
 
 		 239 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00343116  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2446  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  125  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0805764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3839  condensin subunit ScpA  33.47 
 
 		 283 aa  125  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.203132  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4498  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.02 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.535482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1414  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.02 
 
 		 284 aa  125  6e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.605574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2773  condensin subunit ScpA  32.92 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.601165 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2815  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.06 
 
 		 286 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.036308  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1996  putative segregation and condensation protein A  32.92 
 
 		 248 aa  125  9e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1011  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.82 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1687  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.33 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.331985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1039  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.76 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287591  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2356  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.226731 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2488  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.23 
 
 		 290 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.963803  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3487  condensin subunit ScpA  31.4 
 
 		 291 aa  123  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.779049 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0886  hypothetical protein  38.62 
 
 		 247 aa  123  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.855762  hitchhiker  0.000000000000790722 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2207  segregation and condensation protein A  34.02 
 
 		 271 aa  123  4e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1652  chromosome segregation and condensation protein ScpA  36.64 
 
 		 240 aa  122  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.681706 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1157  condensin subunit ScpA  32.23 
 
 		 283 aa  122  4e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.995022 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1736  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.96 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1646  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.27 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.335542  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0981  segregation and condensation protein  34.18 
 
 		 275 aa  122  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2386  hypothetical protein  32.64 
 
 		 293 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000700551 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1838  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.89 
 
 		 297 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0685571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1398  segregation and condensation protein A  32.93 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.331498  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1004  condensin subunit ScpA  36.36 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2909  chromosome segregation and condensation protein ScpA  33.89 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.136298 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1079  chromosome segregation and condensation protein ScpA  32.92 
 
 		 276 aa  122  8e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0111  chromosome segregation and condensation protein ScpA  35.48 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0874  segregation and condensation protein A  33.76 
 
 		 266 aa  121  9.999999999999999e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2599  chromosome segregation and condensation protein ScpA  31.4 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.495238 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2758  chromosome segregation and condensation protein ScpA  34.07 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0371635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>