More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2167 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2167  SEC-C motif domain protein  100 
 
 		 388 aa  806    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1429  SEC-C motif domain protein  39.65 
 
 		 384 aa  277  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0229  preprotein translocase subunit SecA  44.59 
 
 		 896 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0140186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0589  preprotein translocase, SecA subunit  46.88 
 
 		 910 aa  67.4  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0760479  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3237  YgfB and YecA  47.37 
 
 		 235 aa  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2873  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0466  preprotein translocase subunit SecA  70.27 
 
 		 888 aa  65.5  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2104  preprotein translocase, SecA subunit  68.57 
 
 		 848 aa  63.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000251511  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2443  preprotein translocase subunit SecA  47.54 
 
 		 912 aa  63.9  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.163659  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3318  preprotein translocase subunit SecA  40 
 
 		 838 aa  63.9  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.338485  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1082  preprotein translocase subunit SecA  82.14 
 
 		 864 aa  63.5  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1898  preprotein translocase subunit SecA  60.98 
 
 		 922 aa  62.4  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2483  preprotein translocase, SecA subunit  78.57 
 
 		 859 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2011  preprotein translocase subunit SecA  75 
 
 		 836 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0244  yecA family protein  77.42 
 
 		 253 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2323  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 896 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000487805  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3971  preprotein translocase subunit SecA  52.94 
 
 		 872 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000111083  unclonable  0.000000000374715 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1419  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1565  preprotein translocase subunit SecA  81.48 
 
 		 896 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0477  preprotein translocase subunit SecA  60 
 
 		 897 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000253416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004483  protein export cytoplasm protein SecA ATPase RNA helicase  74.19 
 
 		 909 aa  61.2  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341931  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2736  SecC motif-containing protein  79.31 
 
 		 162 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.122843 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0657  preprotein translocase subunit SecA  54 
 
 		 897 aa  60.8  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2859  yecA family protein  35.53 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.448598  normal  0.212674 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1972  preprotein translocase subunit SecA  68.75 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000194313  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  56.41 
 
 		 903 aa  60.5  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00909  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 909 aa  60.5  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1526  preprotein translocase subunit SecA  69.7 
 
 		 958 aa  60.5  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614372  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0052  preprotein translocase, SecA subunit  95.45 
 
 		 866 aa  60.1  0.00000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3165  hypothetical protein  42.47 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.550145  normal  0.0595917 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2485  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 917 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00468846  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3327  protein translocase subunit secA  64.52 
 
 		 901 aa  59.7  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0849  SEC-C motif domain protein  85.19 
 
 		 170 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.132285  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4747  preprotein translocase, SecA subunit  50 
 
 		 834 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000758665  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0504  hypothetical protein  88 
 
 		 166 aa  59.3  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000296754  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2086  protein translocase subunit secA  86.96 
 
 		 909 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511235 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  65.62 
 
 		 908 aa  58.9  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3195  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 837 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0856  preprotein translocase subunit SecA  49.12 
 
 		 917 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0137755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1621  protein translocase subunit secA  70.59 
 
 		 902 aa  58.9  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782819  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2814  SecC motif-containing protein  63.64 
 
 		 61 aa  58.5  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.720005  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  48.39 
 
 		 944 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1680  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 842 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2690  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 957 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  9.11051e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0369  preprotein translocase, SecA subunit  90.91 
 
 		 1136 aa  57.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0205  SecC motif-containing protein  81.48 
 
 		 162 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  44.07 
 
 		 910 aa  58.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0938  preprotein translocase subunit SecA  74.19 
 
 		 884 aa  57.8  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2445  hypothetical protein  81.48 
 
 		 318 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0811  preprotein translocase, SecA subunit  80.77 
 
 		 899 aa  58.2  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3008  preprotein translocase subunit SecA  79.31 
 
 		 837 aa  57.8  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000288137  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  87.5 
 
 		 901 aa  57.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1865  SecC motif-containing protein  31.88 
 
 		 257 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356111  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00099  translocase  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00554961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00098  hypothetical protein  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00533213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1863  SecC motif-containing protein  91.3 
 
 		 800 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0106  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000279351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1794  preprotein translocase subunit SecA  82.61 
 
 		 894 aa  57.4  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00704006  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5791  yecA family protein  30 
 
 		 236 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0092  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000405239  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0104  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 901 aa  57.4  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0238  hypothetical protein  80.77 
 
 		 830 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0889025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2000  yecA family protein  33.62 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1155  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 906 aa  57.4  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0110227  normal  0.328192 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2368  preprotein translocase, SecA subunit  70.37 
 
 		 1200 aa  57.4  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464933  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18560  SEC-C motif domain protein  90.91 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4216  SecC motif-containing protein  88.46 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.900488  normal  0.210806 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0190  preprotein translocase, SecA subunit  90.48 
 
 		 921 aa  57  0.0000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.893566  normal  0.461403 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1445  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 419 aa  57  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0804433  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2706  yecA family protein  47.27 
 
 		 232 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.179188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2940  yecA family protein  47.27 
 
 		 232 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1709  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 858 aa  57  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.283153  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 907 aa  57  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  75.86 
 
 		 897 aa  57  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0779  preprotein translocase, SecA subunit  49.12 
 
 		 925 aa  56.6  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.54499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2456  yecA family protein  90.91 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0418  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 907 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000808939  hitchhiker  0.00000270752 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0176  preprotein translocase, SecA subunit  60 
 
 		 921 aa  56.6  0.0000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0185588  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3445  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 907 aa  56.6  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000355256  hitchhiker  0.0000512951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 900 aa  56.6  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0071  SEC-C motif domain protein  83.33 
 
 		 593 aa  56.6  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4386  transporter  50.98 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.387377  normal  0.216789 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  83.33 
 
 		 916 aa  56.2  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4525  preprotein translocase subunit SecA  68.97 
 
 		 907 aa  56.2  0.0000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000405863  unclonable  0.0000000659986 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1370  SecC motif-containing protein  91.3 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2637  preprotein translocase subunit SecA  72.41 
 
 		 907 aa  56.2  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.064807  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0644  preprotein translocase subunit SecA  79.17 
 
 		 901 aa  55.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.159035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2556  SEC-C motif domain protein  84 
 
 		 239 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  76.92 
 
 		 907 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>